Protein–RNA interactions for Protein: O94788

ALDH1A2, Retinal dehydrogenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A2O94788 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALDH1A2O94788 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALDH1A2O94788 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms