Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRMUO75648 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRMUO75648 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRMUO75648 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRMUO75648 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRMUO75648 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRMUO75648 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRMUO75648 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRMUO75648 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRMUO75648 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRMUO75648 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRMUO75648 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRMUO75648 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRMUO75648 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRMUO75648 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRMUO75648 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRMUO75648 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRMUO75648 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRMUO75648 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRMUO75648 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRMUO75648 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRMUO75648 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRMUO75648 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRMUO75648 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRMUO75648 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRMUO75648 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMUO75648 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMUO75648 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMUO75648 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMUO75648 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMUO75648 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMUO75648 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMUO75648 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMUO75648 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMUO75648 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMUO75648 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMUO75648 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMUO75648 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMUO75648 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMUO75648 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMUO75648 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMUO75648 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMUO75648 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMUO75648 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMUO75648 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMUO75648 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMUO75648 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMUO75648 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMUO75648 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMUO75648 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMUO75648 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMUO75648 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMUO75648 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMUO75648 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMUO75648 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMUO75648 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMUO75648 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMUO75648 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMUO75648 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMUO75648 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMUO75648 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMUO75648 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMUO75648 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMUO75648 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMUO75648 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMUO75648 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMUO75648 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMUO75648 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMUO75648 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMUO75648 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMUO75648 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMUO75648 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMUO75648 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMUO75648 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMUO75648 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMUO75648 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMUO75648 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMUO75648 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMUO75648 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMUO75648 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMUO75648 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMUO75648 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMUO75648 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMUO75648 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMUO75648 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMUO75648 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMUO75648 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMUO75648 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMUO75648 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMUO75648 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMUO75648 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMUO75648 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMUO75648 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMUO75648 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRMUO75648 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMUO75648 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMUO75648 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMUO75648 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMUO75648 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRMUO75648 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms