Protein–RNA interactions for Protein: O75604

USP2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP2O75604 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP2O75604 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP2O75604 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP2O75604 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP2O75604 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP2O75604 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP2O75604 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP2O75604 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP2O75604 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP2O75604 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP2O75604 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP2O75604 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP2O75604 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP2O75604 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP2O75604 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
USP2O75604 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP2O75604 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
USP2O75604 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
USP2O75604 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP2O75604 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP2O75604 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP2O75604 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP2O75604 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP2O75604 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP2O75604 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP2O75604 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP2O75604 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP2O75604 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP2O75604 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP2O75604 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP2O75604 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP2O75604 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
USP2O75604 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP2O75604 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP2O75604 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP2O75604 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP2O75604 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP2O75604 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP2O75604 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP2O75604 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP2O75604 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP2O75604 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP2O75604 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP2O75604 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP2O75604 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP2O75604 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP2O75604 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP2O75604 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP2O75604 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP2O75604 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP2O75604 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP2O75604 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP2O75604 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP2O75604 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP2O75604 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP2O75604 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP2O75604 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP2O75604 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP2O75604 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP2O75604 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP2O75604 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP2O75604 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP2O75604 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP2O75604 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP2O75604 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP2O75604 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP2O75604 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP2O75604 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP2O75604 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP2O75604 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP2O75604 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP2O75604 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP2O75604 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP2O75604 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP2O75604 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP2O75604 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP2O75604 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
USP2O75604 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP2O75604 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP2O75604 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP2O75604 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP2O75604 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP2O75604 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP2O75604 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP2O75604 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP2O75604 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP2O75604 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP2O75604 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
USP2O75604 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
USP2O75604 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP2O75604 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP2O75604 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP2O75604 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP2O75604 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
USP2O75604 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP2O75604 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP2O75604 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP2O75604 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP2O75604 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
USP2O75604 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms