Protein–RNA interactions for Protein: O75293

GADD45B, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45BO75293 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GADD45BO75293 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GADD45BO75293 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms