Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 ZNF513-203ENST00000436006 510 ntTSL 219.02■□□□□ 0.644e-7■■■■□ 23.9
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PRPF4O43172 NUP50-207ENST00000424634 579 ntTSL 317.51■□□□□ 0.394e-7■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 NUP50-208ENST00000430547 537 ntTSL 416.79■□□□□ 0.284e-7■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.034e-7■■■■□ 23.9
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PRPF4O43172 NUP50-213ENST00000461437 531 ntTSL 414.68□□□□□ -0.064e-7■■■■□ 23.9
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PRPF4O43172 NUP50-219ENST00000497960 986 ntTSL 214.61□□□□□ -0.074e-7■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 NUP50-215ENST00000484186 431 ntTSL 58.98□□□□□ -0.974e-7■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 BRD2-217ENST00000584808 547 ntTSL 419.19■□□□□ 0.663e-6■■■■□ 23.9
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PRPF4O43172 SDF2-209ENST00000591903 735 ntTSL 39.65□□□□□ -0.862e-6■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 SDF2-203ENST00000585749 823 ntTSL 38.77□□□□□ -1.012e-6■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 SDF2-207ENST00000588472 681 ntTSL 28.4□□□□□ -1.062e-6■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 SDF2-204ENST00000587338 583 ntTSL 38.1□□□□□ -1.112e-6■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 SDF2-210ENST00000592250 1025 ntTSL 27.82□□□□□ -1.162e-6■■■■□ 23.9
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PRPF4O43172 CNN2-212ENST00000607102 307 ntTSL 1 (best)15.94■□□□□ 0.141e-6■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.071e-6■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.071e-6■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.071e-6■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 CNN2-210ENST00000569352 731 ntTSL 514.48□□□□□ -0.091e-6■■■■□ 23.9
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PRPF4O43172 CNN2-207ENST00000565096 2109 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.491e-6■■■■□ 23.9
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PRPF4O43172 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.196e-7■■■■□ 23.9
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PRPF4O43172 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.011e-6■■■■□ 23.8
PRPF4O43172 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.311e-6■■■■□ 23.8
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PRPF4O43172 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.32e-6■■■■□ 23.8
PRPF4O43172 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.742e-6■■■■□ 23.8
PRPF4O43172 ELOC-203ENST00000519082 634 ntTSL 212.75□□□□□ -0.372e-6■■■■□ 23.8
PRPF4O43172 ELOC-202ENST00000518127 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.822e-6■■■■□ 23.8
PRPF4O43172 ELOC-205ENST00000520210 1451 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.132e-6■■■■□ 23.8
PRPF4O43172 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.472e-6■■■■□ 23.8
PRPF4O43172 KBTBD2-204ENST00000452926 537 ntTSL 414.01□□□□□ -0.178e-8■■■■□ 23.8
PRPF4O43172 KBTBD2-207ENST00000485611 537 ntTSL 414.01□□□□□ -0.178e-8■■■■□ 23.8
PRPF4O43172 KBTBD2-203ENST00000424468 593 ntTSL 47.58□□□□□ -1.28e-8■■■■□ 23.8
PRPF4O43172 KBTBD2-205ENST00000453627 724 ntTSL 35.09□□□□□ -1.598e-8■■■■□ 23.8
PRPF4O43172 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.213e-6■■■■□ 23.7
PRPF4O43172 PDE6D-205ENST00000486044 1005 ntTSL 215.42■□□□□ 0.063e-6■■■■□ 23.7
PRPF4O43172 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.13e-6■■■■□ 23.7
PRPF4O43172 PDE6D-203ENST00000428104 627 ntTSL 313.54□□□□□ -0.243e-6■■■■□ 23.7
PRPF4O43172 PDE6D-204ENST00000477748 996 ntTSL 1 (best)13.44□□□□□ -0.263e-6■■■■□ 23.7
PRPF4O43172 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.631e-6■■■■□ 23.7
PRPF4O43172 SLC26A6-214ENST00000462009 825 ntTSL 318.89■□□□□ 0.616e-9■■■■□ 23.7
PRPF4O43172 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.177e-8■■■■□ 23.7
PRPF4O43172 TAF4-203ENST00000474089 532 ntTSL 218.56■□□□□ 0.561e-6■■■■□ 23.7
PRPF4O43172 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.141e-6■■■■□ 23.7
PRPF4O43172 UNKL-207ENST00000403703 4281 ntTSL 1 (best)13.8□□□□□ -0.21e-6■■■■□ 23.7
PRPF4O43172 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.123e-7■■■■□ 23.7
PRPF4O43172 THAP4-201ENST00000321679 581 ntTSL 213.42□□□□□ -0.263e-7■■■■□ 23.7
PRPF4O43172 THAP4-205ENST00000497486 567 ntTSL 512.13□□□□□ -0.473e-7■■■■□ 23.7
PRPF4O43172 THAP4-203ENST00000402545 833 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.563e-7■■■■□ 23.7
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