Protein–RNA interactions for Protein: O00501

CLDN5, Claudin-5, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN5O00501 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN5O00501 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN5O00501 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms