Protein–RNA interactions for Protein: O00295

TULP2, Tubby-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP2O00295 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TULP2O00295 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TULP2O00295 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TULP2O00295 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TULP2O00295 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TULP2O00295 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TULP2O00295 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TULP2O00295 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TULP2O00295 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TULP2O00295 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TULP2O00295 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TULP2O00295 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TULP2O00295 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TULP2O00295 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TULP2O00295 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TULP2O00295 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TULP2O00295 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TULP2O00295 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TULP2O00295 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TULP2O00295 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TULP2O00295 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TULP2O00295 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TULP2O00295 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TULP2O00295 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TULP2O00295 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP2O00295 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP2O00295 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP2O00295 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP2O00295 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP2O00295 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP2O00295 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP2O00295 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP2O00295 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP2O00295 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP2O00295 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP2O00295 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP2O00295 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP2O00295 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP2O00295 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP2O00295 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TULP2O00295 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TULP2O00295 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TULP2O00295 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TULP2O00295 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TULP2O00295 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TULP2O00295 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TULP2O00295 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TULP2O00295 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TULP2O00295 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TULP2O00295 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TULP2O00295 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TULP2O00295 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TULP2O00295 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TULP2O00295 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TULP2O00295 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TULP2O00295 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TULP2O00295 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TULP2O00295 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TULP2O00295 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TULP2O00295 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TULP2O00295 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TULP2O00295 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TULP2O00295 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TULP2O00295 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TULP2O00295 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TULP2O00295 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TULP2O00295 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TULP2O00295 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TULP2O00295 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TULP2O00295 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TULP2O00295 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TULP2O00295 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TULP2O00295 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TULP2O00295 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TULP2O00295 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TULP2O00295 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TULP2O00295 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TULP2O00295 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TULP2O00295 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TULP2O00295 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TULP2O00295 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TULP2O00295 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TULP2O00295 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TULP2O00295 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TULP2O00295 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TULP2O00295 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TULP2O00295 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TULP2O00295 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TULP2O00295 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TULP2O00295 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TULP2O00295 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TULP2O00295 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TULP2O00295 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TULP2O00295 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TULP2O00295 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TULP2O00295 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TULP2O00295 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TULP2O00295 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TULP2O00295 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TULP2O00295 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms