Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms