Protein–RNA interactions for Protein: H3BU86

STX16-NPEPL1, STX16-NPEPL1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX16-NPEPL1H3BU86 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
STX16-NPEPL1H3BU86 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
STX16-NPEPL1H3BU86 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
STX16-NPEPL1H3BU86 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
STX16-NPEPL1H3BU86 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
STX16-NPEPL1H3BU86 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
STX16-NPEPL1H3BU86 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
STX16-NPEPL1H3BU86 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
STX16-NPEPL1H3BU86 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
STX16-NPEPL1H3BU86 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
STX16-NPEPL1H3BU86 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
STX16-NPEPL1H3BU86 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
STX16-NPEPL1H3BU86 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
STX16-NPEPL1H3BU86 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
STX16-NPEPL1H3BU86 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
STX16-NPEPL1H3BU86 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
STX16-NPEPL1H3BU86 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX16-NPEPL1H3BU86 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX16-NPEPL1H3BU86 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX16-NPEPL1H3BU86 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX16-NPEPL1H3BU86 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX16-NPEPL1H3BU86 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX16-NPEPL1H3BU86 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX16-NPEPL1H3BU86 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX16-NPEPL1H3BU86 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX16-NPEPL1H3BU86 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
STX16-NPEPL1H3BU86 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms