Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF879B4DU55 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZNF879B4DU55 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZNF879B4DU55 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF879B4DU55 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms