Protein–RNA interactions for Protein: A8MUI8

Putative UPF0607 protein ENSP00000383783, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MUI8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A8MUI8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A8MUI8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A8MUI8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A8MUI8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A8MUI8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A8MUI8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A8MUI8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A8MUI8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A8MUI8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A8MUI8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A8MUI8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A8MUI8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A8MUI8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A8MUI8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A8MUI8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A8MUI8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A8MUI8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A8MUI8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
A8MUI8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
A8MUI8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A8MUI8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A8MUI8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A8MUI8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A8MUI8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A8MUI8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A8MUI8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A8MUI8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A8MUI8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A8MUI8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A8MUI8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A8MUI8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A8MUI8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A8MUI8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A8MUI8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A8MUI8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A8MUI8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A8MUI8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A8MUI8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A8MUI8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A8MUI8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A8MUI8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
A8MUI8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A8MUI8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A8MUI8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A8MUI8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A8MUI8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A8MUI8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A8MUI8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A8MUI8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A8MUI8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A8MUI8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A8MUI8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A8MUI8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A8MUI8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A8MUI8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A8MUI8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A8MUI8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A8MUI8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A8MUI8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A8MUI8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A8MUI8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A8MUI8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A8MUI8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A8MUI8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A8MUI8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A8MUI8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A8MUI8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
A8MUI8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A8MUI8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A8MUI8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A8MUI8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A8MUI8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A8MUI8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A8MUI8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A8MUI8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A8MUI8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
A8MUI8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A8MUI8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A8MUI8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A8MUI8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A8MUI8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A8MUI8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A8MUI8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A8MUI8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A8MUI8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A8MUI8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A8MUI8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A8MUI8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A8MUI8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A8MUI8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A8MUI8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A8MUI8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A8MUI8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A8MUI8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A8MUI8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A8MUI8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A8MUI8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A8MUI8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A8MUI8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms