Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CFAP73A6NFT4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CFAP73A6NFT4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms