Protein–RNA interactions for Protein: A4D0T7

SMIM30, Small integral membrane protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM30A4D0T7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMIM30A4D0T7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMIM30A4D0T7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM30A4D0T7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM30A4D0T7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM30A4D0T7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM30A4D0T7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM30A4D0T7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM30A4D0T7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM30A4D0T7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM30A4D0T7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM30A4D0T7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM30A4D0T7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM30A4D0T7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM30A4D0T7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM30A4D0T7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM30A4D0T7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM30A4D0T7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM30A4D0T7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM30A4D0T7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM30A4D0T7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM30A4D0T7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM30A4D0T7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMIM30A4D0T7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMIM30A4D0T7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMIM30A4D0T7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SMIM30A4D0T7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMIM30A4D0T7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMIM30A4D0T7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SMIM30A4D0T7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SMIM30A4D0T7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMIM30A4D0T7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms