Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQC6

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQC6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1W2PQC6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1W2PQC6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1W2PQC6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1W2PQC6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1W2PQC6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1W2PQC6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1W2PQC6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1W2PQC6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1W2PQC6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1W2PQC6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A1W2PQC6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A1W2PQC6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A1W2PQC6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A1W2PQC6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A1W2PQC6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A1W2PQC6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A1W2PQC6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1W2PQC6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1W2PQC6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1W2PQC6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1W2PQC6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1W2PQC6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1W2PQC6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1W2PQC6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1W2PQC6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1W2PQC6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
A0A1W2PQC6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
A0A1W2PQC6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
A0A1W2PQC6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
A0A1W2PQC6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
A0A1W2PQC6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A1W2PQC6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A1W2PQC6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms