Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T4

PPP2R2C, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B gamma isoform, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2R2CQ9Y2T4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPP2R2CQ9Y2T4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPP2R2CQ9Y2T4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPP2R2CQ9Y2T4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPP2R2CQ9Y2T4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPP2R2CQ9Y2T4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPP2R2CQ9Y2T4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPP2R2CQ9Y2T4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPP2R2CQ9Y2T4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PPP2R2CQ9Y2T4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PPP2R2CQ9Y2T4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PPP2R2CQ9Y2T4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PPP2R2CQ9Y2T4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PPP2R2CQ9Y2T4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PPP2R2CQ9Y2T4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PPP2R2CQ9Y2T4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PPP2R2CQ9Y2T4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPP2R2CQ9Y2T4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPP2R2CQ9Y2T4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPP2R2CQ9Y2T4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPP2R2CQ9Y2T4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPP2R2CQ9Y2T4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPP2R2CQ9Y2T4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPP2R2CQ9Y2T4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPP2R2CQ9Y2T4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PPP2R2CQ9Y2T4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPP2R2CQ9Y2T4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPP2R2CQ9Y2T4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PPP2R2CQ9Y2T4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPP2R2CQ9Y2T4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PPP2R2CQ9Y2T4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPP2R2CQ9Y2T4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PPP2R2CQ9Y2T4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPP2R2CQ9Y2T4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPP2R2CQ9Y2T4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPP2R2CQ9Y2T4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPP2R2CQ9Y2T4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PPP2R2CQ9Y2T4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PPP2R2CQ9Y2T4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PPP2R2CQ9Y2T4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PPP2R2CQ9Y2T4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPP2R2CQ9Y2T4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPP2R2CQ9Y2T4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PPP2R2CQ9Y2T4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PPP2R2CQ9Y2T4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPP2R2CQ9Y2T4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPP2R2CQ9Y2T4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPP2R2CQ9Y2T4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPP2R2CQ9Y2T4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPP2R2CQ9Y2T4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPP2R2CQ9Y2T4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPP2R2CQ9Y2T4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPP2R2CQ9Y2T4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPP2R2CQ9Y2T4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPP2R2CQ9Y2T4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPP2R2CQ9Y2T4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPP2R2CQ9Y2T4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPP2R2CQ9Y2T4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPP2R2CQ9Y2T4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPP2R2CQ9Y2T4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PPP2R2CQ9Y2T4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPP2R2CQ9Y2T4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPP2R2CQ9Y2T4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPP2R2CQ9Y2T4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPP2R2CQ9Y2T4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PPP2R2CQ9Y2T4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPP2R2CQ9Y2T4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPP2R2CQ9Y2T4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPP2R2CQ9Y2T4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPP2R2CQ9Y2T4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPP2R2CQ9Y2T4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPP2R2CQ9Y2T4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPP2R2CQ9Y2T4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPP2R2CQ9Y2T4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPP2R2CQ9Y2T4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PPP2R2CQ9Y2T4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PPP2R2CQ9Y2T4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPP2R2CQ9Y2T4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPP2R2CQ9Y2T4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPP2R2CQ9Y2T4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPP2R2CQ9Y2T4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPP2R2CQ9Y2T4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPP2R2CQ9Y2T4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPP2R2CQ9Y2T4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPP2R2CQ9Y2T4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPP2R2CQ9Y2T4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPP2R2CQ9Y2T4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPP2R2CQ9Y2T4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPP2R2CQ9Y2T4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPP2R2CQ9Y2T4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPP2R2CQ9Y2T4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPP2R2CQ9Y2T4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPP2R2CQ9Y2T4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPP2R2CQ9Y2T4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPP2R2CQ9Y2T4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPP2R2CQ9Y2T4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPP2R2CQ9Y2T4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPP2R2CQ9Y2T4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPP2R2CQ9Y2T4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPP2R2CQ9Y2T4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms