Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2P8

RCL1, RNA 3'-terminal phosphate cyclase-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCL1Q9Y2P8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCL1Q9Y2P8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RCL1Q9Y2P8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCL1Q9Y2P8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCL1Q9Y2P8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCL1Q9Y2P8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCL1Q9Y2P8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCL1Q9Y2P8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCL1Q9Y2P8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCL1Q9Y2P8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCL1Q9Y2P8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCL1Q9Y2P8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCL1Q9Y2P8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCL1Q9Y2P8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCL1Q9Y2P8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCL1Q9Y2P8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCL1Q9Y2P8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCL1Q9Y2P8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCL1Q9Y2P8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCL1Q9Y2P8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCL1Q9Y2P8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCL1Q9Y2P8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCL1Q9Y2P8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCL1Q9Y2P8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCL1Q9Y2P8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCL1Q9Y2P8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCL1Q9Y2P8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RCL1Q9Y2P8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCL1Q9Y2P8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCL1Q9Y2P8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCL1Q9Y2P8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCL1Q9Y2P8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCL1Q9Y2P8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCL1Q9Y2P8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCL1Q9Y2P8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCL1Q9Y2P8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCL1Q9Y2P8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCL1Q9Y2P8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCL1Q9Y2P8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCL1Q9Y2P8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RCL1Q9Y2P8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RCL1Q9Y2P8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCL1Q9Y2P8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCL1Q9Y2P8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCL1Q9Y2P8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCL1Q9Y2P8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCL1Q9Y2P8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RCL1Q9Y2P8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCL1Q9Y2P8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RCL1Q9Y2P8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCL1Q9Y2P8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCL1Q9Y2P8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RCL1Q9Y2P8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RCL1Q9Y2P8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RCL1Q9Y2P8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RCL1Q9Y2P8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCL1Q9Y2P8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RCL1Q9Y2P8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RCL1Q9Y2P8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RCL1Q9Y2P8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RCL1Q9Y2P8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RCL1Q9Y2P8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RCL1Q9Y2P8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RCL1Q9Y2P8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RCL1Q9Y2P8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RCL1Q9Y2P8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RCL1Q9Y2P8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RCL1Q9Y2P8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RCL1Q9Y2P8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RCL1Q9Y2P8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RCL1Q9Y2P8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCL1Q9Y2P8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RCL1Q9Y2P8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RCL1Q9Y2P8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RCL1Q9Y2P8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RCL1Q9Y2P8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RCL1Q9Y2P8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCL1Q9Y2P8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCL1Q9Y2P8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCL1Q9Y2P8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCL1Q9Y2P8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCL1Q9Y2P8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCL1Q9Y2P8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RCL1Q9Y2P8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RCL1Q9Y2P8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RCL1Q9Y2P8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RCL1Q9Y2P8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RCL1Q9Y2P8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RCL1Q9Y2P8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RCL1Q9Y2P8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RCL1Q9Y2P8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RCL1Q9Y2P8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RCL1Q9Y2P8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RCL1Q9Y2P8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RCL1Q9Y2P8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RCL1Q9Y2P8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RCL1Q9Y2P8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RCL1Q9Y2P8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RCL1Q9Y2P8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RCL1Q9Y2P8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms