Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L9

LRCH1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH1Q9Y2L9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRCH1Q9Y2L9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRCH1Q9Y2L9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRCH1Q9Y2L9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRCH1Q9Y2L9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRCH1Q9Y2L9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRCH1Q9Y2L9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRCH1Q9Y2L9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRCH1Q9Y2L9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRCH1Q9Y2L9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRCH1Q9Y2L9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRCH1Q9Y2L9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRCH1Q9Y2L9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRCH1Q9Y2L9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRCH1Q9Y2L9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRCH1Q9Y2L9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRCH1Q9Y2L9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRCH1Q9Y2L9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRCH1Q9Y2L9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRCH1Q9Y2L9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRCH1Q9Y2L9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRCH1Q9Y2L9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRCH1Q9Y2L9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRCH1Q9Y2L9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRCH1Q9Y2L9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRCH1Q9Y2L9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRCH1Q9Y2L9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRCH1Q9Y2L9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRCH1Q9Y2L9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRCH1Q9Y2L9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRCH1Q9Y2L9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRCH1Q9Y2L9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRCH1Q9Y2L9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRCH1Q9Y2L9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRCH1Q9Y2L9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
LRCH1Q9Y2L9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRCH1Q9Y2L9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRCH1Q9Y2L9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRCH1Q9Y2L9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRCH1Q9Y2L9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRCH1Q9Y2L9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRCH1Q9Y2L9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LRCH1Q9Y2L9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRCH1Q9Y2L9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRCH1Q9Y2L9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRCH1Q9Y2L9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRCH1Q9Y2L9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRCH1Q9Y2L9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRCH1Q9Y2L9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRCH1Q9Y2L9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRCH1Q9Y2L9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRCH1Q9Y2L9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRCH1Q9Y2L9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRCH1Q9Y2L9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRCH1Q9Y2L9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRCH1Q9Y2L9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRCH1Q9Y2L9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRCH1Q9Y2L9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRCH1Q9Y2L9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRCH1Q9Y2L9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRCH1Q9Y2L9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRCH1Q9Y2L9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRCH1Q9Y2L9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRCH1Q9Y2L9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRCH1Q9Y2L9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRCH1Q9Y2L9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRCH1Q9Y2L9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRCH1Q9Y2L9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRCH1Q9Y2L9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRCH1Q9Y2L9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRCH1Q9Y2L9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRCH1Q9Y2L9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRCH1Q9Y2L9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRCH1Q9Y2L9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRCH1Q9Y2L9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRCH1Q9Y2L9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRCH1Q9Y2L9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRCH1Q9Y2L9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRCH1Q9Y2L9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRCH1Q9Y2L9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRCH1Q9Y2L9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRCH1Q9Y2L9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRCH1Q9Y2L9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRCH1Q9Y2L9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRCH1Q9Y2L9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRCH1Q9Y2L9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRCH1Q9Y2L9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRCH1Q9Y2L9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRCH1Q9Y2L9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRCH1Q9Y2L9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRCH1Q9Y2L9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRCH1Q9Y2L9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRCH1Q9Y2L9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRCH1Q9Y2L9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRCH1Q9Y2L9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LRCH1Q9Y2L9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRCH1Q9Y2L9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRCH1Q9Y2L9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRCH1Q9Y2L9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LRCH1Q9Y2L9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms