Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y289

SLC5A6, Sodium-dependent multivitamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A6Q9Y289 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC5A6Q9Y289 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC5A6Q9Y289 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC5A6Q9Y289 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC5A6Q9Y289 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC5A6Q9Y289 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC5A6Q9Y289 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC5A6Q9Y289 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC5A6Q9Y289 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC5A6Q9Y289 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC5A6Q9Y289 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC5A6Q9Y289 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC5A6Q9Y289 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC5A6Q9Y289 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC5A6Q9Y289 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC5A6Q9Y289 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC5A6Q9Y289 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC5A6Q9Y289 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC5A6Q9Y289 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A6Q9Y289 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A6Q9Y289 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC5A6Q9Y289 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC5A6Q9Y289 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC5A6Q9Y289 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC5A6Q9Y289 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC5A6Q9Y289 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A6Q9Y289 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC5A6Q9Y289 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC5A6Q9Y289 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC5A6Q9Y289 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC5A6Q9Y289 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC5A6Q9Y289 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC5A6Q9Y289 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC5A6Q9Y289 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC5A6Q9Y289 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC5A6Q9Y289 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC5A6Q9Y289 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC5A6Q9Y289 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC5A6Q9Y289 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC5A6Q9Y289 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC5A6Q9Y289 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC5A6Q9Y289 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC5A6Q9Y289 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC5A6Q9Y289 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC5A6Q9Y289 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC5A6Q9Y289 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A6Q9Y289 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A6Q9Y289 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A6Q9Y289 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A6Q9Y289 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A6Q9Y289 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A6Q9Y289 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A6Q9Y289 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A6Q9Y289 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A6Q9Y289 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A6Q9Y289 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A6Q9Y289 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A6Q9Y289 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A6Q9Y289 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC5A6Q9Y289 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC5A6Q9Y289 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC5A6Q9Y289 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC5A6Q9Y289 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC5A6Q9Y289 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC5A6Q9Y289 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC5A6Q9Y289 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC5A6Q9Y289 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC5A6Q9Y289 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC5A6Q9Y289 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC5A6Q9Y289 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC5A6Q9Y289 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC5A6Q9Y289 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC5A6Q9Y289 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC5A6Q9Y289 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC5A6Q9Y289 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC5A6Q9Y289 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A6Q9Y289 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A6Q9Y289 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A6Q9Y289 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC5A6Q9Y289 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC5A6Q9Y289 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC5A6Q9Y289 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC5A6Q9Y289 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC5A6Q9Y289 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC5A6Q9Y289 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC5A6Q9Y289 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC5A6Q9Y289 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC5A6Q9Y289 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC5A6Q9Y289 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC5A6Q9Y289 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC5A6Q9Y289 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC5A6Q9Y289 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC5A6Q9Y289 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC5A6Q9Y289 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC5A6Q9Y289 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC5A6Q9Y289 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC5A6Q9Y289 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC5A6Q9Y289 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC5A6Q9Y289 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC5A6Q9Y289 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms