Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y279

VSIG4, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG4Q9Y279 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSIG4Q9Y279 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSIG4Q9Y279 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSIG4Q9Y279 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VSIG4Q9Y279 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VSIG4Q9Y279 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSIG4Q9Y279 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSIG4Q9Y279 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSIG4Q9Y279 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSIG4Q9Y279 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSIG4Q9Y279 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VSIG4Q9Y279 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VSIG4Q9Y279 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VSIG4Q9Y279 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSIG4Q9Y279 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSIG4Q9Y279 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSIG4Q9Y279 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSIG4Q9Y279 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSIG4Q9Y279 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSIG4Q9Y279 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSIG4Q9Y279 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSIG4Q9Y279 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSIG4Q9Y279 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSIG4Q9Y279 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSIG4Q9Y279 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSIG4Q9Y279 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSIG4Q9Y279 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSIG4Q9Y279 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSIG4Q9Y279 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSIG4Q9Y279 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSIG4Q9Y279 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSIG4Q9Y279 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSIG4Q9Y279 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSIG4Q9Y279 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSIG4Q9Y279 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSIG4Q9Y279 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG4Q9Y279 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG4Q9Y279 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSIG4Q9Y279 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSIG4Q9Y279 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSIG4Q9Y279 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSIG4Q9Y279 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSIG4Q9Y279 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSIG4Q9Y279 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSIG4Q9Y279 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSIG4Q9Y279 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSIG4Q9Y279 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSIG4Q9Y279 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSIG4Q9Y279 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VSIG4Q9Y279 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSIG4Q9Y279 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSIG4Q9Y279 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSIG4Q9Y279 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VSIG4Q9Y279 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VSIG4Q9Y279 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VSIG4Q9Y279 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VSIG4Q9Y279 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VSIG4Q9Y279 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSIG4Q9Y279 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSIG4Q9Y279 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSIG4Q9Y279 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSIG4Q9Y279 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSIG4Q9Y279 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSIG4Q9Y279 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VSIG4Q9Y279 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VSIG4Q9Y279 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VSIG4Q9Y279 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VSIG4Q9Y279 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VSIG4Q9Y279 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VSIG4Q9Y279 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VSIG4Q9Y279 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSIG4Q9Y279 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSIG4Q9Y279 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSIG4Q9Y279 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSIG4Q9Y279 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VSIG4Q9Y279 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSIG4Q9Y279 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSIG4Q9Y279 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSIG4Q9Y279 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSIG4Q9Y279 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSIG4Q9Y279 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VSIG4Q9Y279 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSIG4Q9Y279 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSIG4Q9Y279 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSIG4Q9Y279 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSIG4Q9Y279 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSIG4Q9Y279 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSIG4Q9Y279 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VSIG4Q9Y279 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VSIG4Q9Y279 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VSIG4Q9Y279 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VSIG4Q9Y279 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VSIG4Q9Y279 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSIG4Q9Y279 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSIG4Q9Y279 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSIG4Q9Y279 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSIG4Q9Y279 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSIG4Q9Y279 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSIG4Q9Y279 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
VSIG4Q9Y279 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms