Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y279

VSIG4, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG4Q9Y279 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSIG4Q9Y279 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSIG4Q9Y279 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSIG4Q9Y279 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VSIG4Q9Y279 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VSIG4Q9Y279 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSIG4Q9Y279 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSIG4Q9Y279 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSIG4Q9Y279 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSIG4Q9Y279 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSIG4Q9Y279 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VSIG4Q9Y279 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VSIG4Q9Y279 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VSIG4Q9Y279 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSIG4Q9Y279 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSIG4Q9Y279 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSIG4Q9Y279 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSIG4Q9Y279 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSIG4Q9Y279 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSIG4Q9Y279 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSIG4Q9Y279 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSIG4Q9Y279 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSIG4Q9Y279 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSIG4Q9Y279 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSIG4Q9Y279 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSIG4Q9Y279 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSIG4Q9Y279 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSIG4Q9Y279 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSIG4Q9Y279 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSIG4Q9Y279 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSIG4Q9Y279 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSIG4Q9Y279 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSIG4Q9Y279 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSIG4Q9Y279 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSIG4Q9Y279 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSIG4Q9Y279 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG4Q9Y279 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSIG4Q9Y279 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSIG4Q9Y279 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSIG4Q9Y279 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSIG4Q9Y279 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSIG4Q9Y279 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSIG4Q9Y279 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSIG4Q9Y279 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VSIG4Q9Y279 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSIG4Q9Y279 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSIG4Q9Y279 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSIG4Q9Y279 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VSIG4Q9Y279 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VSIG4Q9Y279 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSIG4Q9Y279 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSIG4Q9Y279 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VSIG4Q9Y279 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VSIG4Q9Y279 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VSIG4Q9Y279 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VSIG4Q9Y279 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VSIG4Q9Y279 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VSIG4Q9Y279 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSIG4Q9Y279 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSIG4Q9Y279 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSIG4Q9Y279 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSIG4Q9Y279 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSIG4Q9Y279 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSIG4Q9Y279 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VSIG4Q9Y279 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VSIG4Q9Y279 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VSIG4Q9Y279 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VSIG4Q9Y279 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VSIG4Q9Y279 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VSIG4Q9Y279 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VSIG4Q9Y279 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSIG4Q9Y279 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSIG4Q9Y279 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSIG4Q9Y279 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSIG4Q9Y279 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VSIG4Q9Y279 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSIG4Q9Y279 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSIG4Q9Y279 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSIG4Q9Y279 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSIG4Q9Y279 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSIG4Q9Y279 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VSIG4Q9Y279 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSIG4Q9Y279 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSIG4Q9Y279 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSIG4Q9Y279 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSIG4Q9Y279 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSIG4Q9Y279 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSIG4Q9Y279 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VSIG4Q9Y279 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VSIG4Q9Y279 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VSIG4Q9Y279 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VSIG4Q9Y279 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VSIG4Q9Y279 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSIG4Q9Y279 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSIG4Q9Y279 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSIG4Q9Y279 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSIG4Q9Y279 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSIG4Q9Y279 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSIG4Q9Y279 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
VSIG4Q9Y279 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms