Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHQ1

NARF, Nuclear prelamin A recognition factor, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NARFQ9UHQ1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NARFQ9UHQ1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NARFQ9UHQ1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NARFQ9UHQ1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NARFQ9UHQ1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NARFQ9UHQ1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NARFQ9UHQ1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
NARFQ9UHQ1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
NARFQ9UHQ1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
NARFQ9UHQ1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
NARFQ9UHQ1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NARFQ9UHQ1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NARFQ9UHQ1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NARFQ9UHQ1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NARFQ9UHQ1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NARFQ9UHQ1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
NARFQ9UHQ1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NARFQ9UHQ1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NARFQ9UHQ1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NARFQ9UHQ1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NARFQ9UHQ1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NARFQ9UHQ1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NARFQ9UHQ1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
NARFQ9UHQ1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
NARFQ9UHQ1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NARFQ9UHQ1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
NARFQ9UHQ1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC34.75■■■■□ 3.15
NARFQ9UHQ1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
NARFQ9UHQ1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NARFQ9UHQ1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NARFQ9UHQ1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
NARFQ9UHQ1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NARFQ9UHQ1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC34.73■■■■□ 3.15
NARFQ9UHQ1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NARFQ9UHQ1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NARFQ9UHQ1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
NARFQ9UHQ1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NARFQ9UHQ1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NARFQ9UHQ1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
NARFQ9UHQ1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NARFQ9UHQ1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
NARFQ9UHQ1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NARFQ9UHQ1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NARFQ9UHQ1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NARFQ9UHQ1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
NARFQ9UHQ1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NARFQ9UHQ1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
NARFQ9UHQ1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NARFQ9UHQ1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
NARFQ9UHQ1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NARFQ9UHQ1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NARFQ9UHQ1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NARFQ9UHQ1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.13
NARFQ9UHQ1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
NARFQ9UHQ1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NARFQ9UHQ1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NARFQ9UHQ1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NARFQ9UHQ1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NARFQ9UHQ1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NARFQ9UHQ1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
NARFQ9UHQ1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
NARFQ9UHQ1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
NARFQ9UHQ1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
NARFQ9UHQ1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
NARFQ9UHQ1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
NARFQ9UHQ1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
NARFQ9UHQ1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NARFQ9UHQ1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
NARFQ9UHQ1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NARFQ9UHQ1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NARFQ9UHQ1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
NARFQ9UHQ1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
NARFQ9UHQ1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
NARFQ9UHQ1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NARFQ9UHQ1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NARFQ9UHQ1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
NARFQ9UHQ1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NARFQ9UHQ1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NARFQ9UHQ1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NARFQ9UHQ1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NARFQ9UHQ1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NARFQ9UHQ1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NARFQ9UHQ1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NARFQ9UHQ1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NARFQ9UHQ1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
NARFQ9UHQ1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NARFQ9UHQ1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NARFQ9UHQ1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
NARFQ9UHQ1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NARFQ9UHQ1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NARFQ9UHQ1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NARFQ9UHQ1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
NARFQ9UHQ1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
NARFQ9UHQ1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NARFQ9UHQ1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NARFQ9UHQ1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NARFQ9UHQ1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NARFQ9UHQ1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
NARFQ9UHQ1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NARFQ9UHQ1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms