Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS4

DNAJB11, DnaJ homolog subfamily B member 11, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB11Q9UBS4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJB11Q9UBS4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJB11Q9UBS4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJB11Q9UBS4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJB11Q9UBS4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJB11Q9UBS4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJB11Q9UBS4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJB11Q9UBS4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAJB11Q9UBS4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAJB11Q9UBS4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJB11Q9UBS4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJB11Q9UBS4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJB11Q9UBS4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJB11Q9UBS4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJB11Q9UBS4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJB11Q9UBS4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJB11Q9UBS4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJB11Q9UBS4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJB11Q9UBS4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJB11Q9UBS4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJB11Q9UBS4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJB11Q9UBS4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJB11Q9UBS4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNAJB11Q9UBS4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJB11Q9UBS4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJB11Q9UBS4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJB11Q9UBS4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJB11Q9UBS4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJB11Q9UBS4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJB11Q9UBS4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJB11Q9UBS4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJB11Q9UBS4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJB11Q9UBS4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJB11Q9UBS4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJB11Q9UBS4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJB11Q9UBS4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJB11Q9UBS4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJB11Q9UBS4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJB11Q9UBS4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJB11Q9UBS4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJB11Q9UBS4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJB11Q9UBS4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJB11Q9UBS4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNAJB11Q9UBS4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNAJB11Q9UBS4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNAJB11Q9UBS4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAJB11Q9UBS4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAJB11Q9UBS4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJB11Q9UBS4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAJB11Q9UBS4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAJB11Q9UBS4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAJB11Q9UBS4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAJB11Q9UBS4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAJB11Q9UBS4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAJB11Q9UBS4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAJB11Q9UBS4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAJB11Q9UBS4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAJB11Q9UBS4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAJB11Q9UBS4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAJB11Q9UBS4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAJB11Q9UBS4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAJB11Q9UBS4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAJB11Q9UBS4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAJB11Q9UBS4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAJB11Q9UBS4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAJB11Q9UBS4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJB11Q9UBS4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJB11Q9UBS4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJB11Q9UBS4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJB11Q9UBS4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAJB11Q9UBS4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAJB11Q9UBS4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJB11Q9UBS4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJB11Q9UBS4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAJB11Q9UBS4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAJB11Q9UBS4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJB11Q9UBS4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJB11Q9UBS4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJB11Q9UBS4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJB11Q9UBS4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJB11Q9UBS4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJB11Q9UBS4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJB11Q9UBS4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJB11Q9UBS4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJB11Q9UBS4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJB11Q9UBS4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJB11Q9UBS4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJB11Q9UBS4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJB11Q9UBS4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJB11Q9UBS4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJB11Q9UBS4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAJB11Q9UBS4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAJB11Q9UBS4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJB11Q9UBS4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAJB11Q9UBS4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJB11Q9UBS4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJB11Q9UBS4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAJB11Q9UBS4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJB11Q9UBS4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJB11Q9UBS4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms