Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00474Q9P2X8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00474Q9P2X8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00474Q9P2X8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00474Q9P2X8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00474Q9P2X8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00474Q9P2X8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00474Q9P2X8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00474Q9P2X8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00474Q9P2X8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00474Q9P2X8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00474Q9P2X8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00474Q9P2X8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00474Q9P2X8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00474Q9P2X8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00474Q9P2X8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00474Q9P2X8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00474Q9P2X8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00474Q9P2X8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00474Q9P2X8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00474Q9P2X8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00474Q9P2X8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00474Q9P2X8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00474Q9P2X8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00474Q9P2X8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00474Q9P2X8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00474Q9P2X8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00474Q9P2X8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00474Q9P2X8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00474Q9P2X8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00474Q9P2X8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00474Q9P2X8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00474Q9P2X8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00474Q9P2X8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00474Q9P2X8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00474Q9P2X8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00474Q9P2X8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00474Q9P2X8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00474Q9P2X8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00474Q9P2X8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00474Q9P2X8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00474Q9P2X8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00474Q9P2X8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00474Q9P2X8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00474Q9P2X8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00474Q9P2X8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00474Q9P2X8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00474Q9P2X8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00474Q9P2X8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00474Q9P2X8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00474Q9P2X8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00474Q9P2X8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00474Q9P2X8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00474Q9P2X8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00474Q9P2X8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00474Q9P2X8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00474Q9P2X8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00474Q9P2X8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00474Q9P2X8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00474Q9P2X8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00474Q9P2X8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00474Q9P2X8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00474Q9P2X8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00474Q9P2X8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00474Q9P2X8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00474Q9P2X8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00474Q9P2X8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00474Q9P2X8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00474Q9P2X8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00474Q9P2X8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00474Q9P2X8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00474Q9P2X8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00474Q9P2X8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00474Q9P2X8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00474Q9P2X8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00474Q9P2X8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00474Q9P2X8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00474Q9P2X8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00474Q9P2X8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00474Q9P2X8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00474Q9P2X8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00474Q9P2X8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00474Q9P2X8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00474Q9P2X8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00474Q9P2X8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00474Q9P2X8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00474Q9P2X8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00474Q9P2X8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00474Q9P2X8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00474Q9P2X8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00474Q9P2X8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00474Q9P2X8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00474Q9P2X8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00474Q9P2X8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00474Q9P2X8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00474Q9P2X8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00474Q9P2X8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00474Q9P2X8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00474Q9P2X8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00474Q9P2X8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms