Protein–RNA interactions for Protein: Q9P000

COMMD9, COMM domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD9Q9P000 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COMMD9Q9P000 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
COMMD9Q9P000 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COMMD9Q9P000 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COMMD9Q9P000 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COMMD9Q9P000 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COMMD9Q9P000 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COMMD9Q9P000 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COMMD9Q9P000 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COMMD9Q9P000 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COMMD9Q9P000 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COMMD9Q9P000 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COMMD9Q9P000 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COMMD9Q9P000 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COMMD9Q9P000 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COMMD9Q9P000 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COMMD9Q9P000 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COMMD9Q9P000 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COMMD9Q9P000 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COMMD9Q9P000 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COMMD9Q9P000 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COMMD9Q9P000 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COMMD9Q9P000 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COMMD9Q9P000 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COMMD9Q9P000 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COMMD9Q9P000 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COMMD9Q9P000 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COMMD9Q9P000 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COMMD9Q9P000 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COMMD9Q9P000 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COMMD9Q9P000 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COMMD9Q9P000 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COMMD9Q9P000 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COMMD9Q9P000 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COMMD9Q9P000 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COMMD9Q9P000 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COMMD9Q9P000 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COMMD9Q9P000 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COMMD9Q9P000 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COMMD9Q9P000 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COMMD9Q9P000 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COMMD9Q9P000 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COMMD9Q9P000 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COMMD9Q9P000 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COMMD9Q9P000 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COMMD9Q9P000 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COMMD9Q9P000 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
COMMD9Q9P000 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COMMD9Q9P000 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COMMD9Q9P000 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COMMD9Q9P000 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COMMD9Q9P000 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COMMD9Q9P000 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COMMD9Q9P000 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COMMD9Q9P000 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COMMD9Q9P000 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COMMD9Q9P000 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COMMD9Q9P000 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COMMD9Q9P000 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COMMD9Q9P000 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COMMD9Q9P000 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COMMD9Q9P000 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COMMD9Q9P000 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COMMD9Q9P000 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COMMD9Q9P000 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COMMD9Q9P000 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COMMD9Q9P000 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COMMD9Q9P000 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COMMD9Q9P000 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COMMD9Q9P000 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COMMD9Q9P000 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COMMD9Q9P000 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COMMD9Q9P000 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
COMMD9Q9P000 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COMMD9Q9P000 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COMMD9Q9P000 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COMMD9Q9P000 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COMMD9Q9P000 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COMMD9Q9P000 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COMMD9Q9P000 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COMMD9Q9P000 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COMMD9Q9P000 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COMMD9Q9P000 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COMMD9Q9P000 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COMMD9Q9P000 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COMMD9Q9P000 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COMMD9Q9P000 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COMMD9Q9P000 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COMMD9Q9P000 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COMMD9Q9P000 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COMMD9Q9P000 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COMMD9Q9P000 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COMMD9Q9P000 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COMMD9Q9P000 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COMMD9Q9P000 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COMMD9Q9P000 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COMMD9Q9P000 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COMMD9Q9P000 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COMMD9Q9P000 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COMMD9Q9P000 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms