Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MSRB1Q9NZV6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MSRB1Q9NZV6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MSRB1Q9NZV6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MSRB1Q9NZV6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MSRB1Q9NZV6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MSRB1Q9NZV6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MSRB1Q9NZV6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MSRB1Q9NZV6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MSRB1Q9NZV6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MSRB1Q9NZV6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MSRB1Q9NZV6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MSRB1Q9NZV6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MSRB1Q9NZV6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MSRB1Q9NZV6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MSRB1Q9NZV6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MSRB1Q9NZV6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MSRB1Q9NZV6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MSRB1Q9NZV6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MSRB1Q9NZV6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MSRB1Q9NZV6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MSRB1Q9NZV6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MSRB1Q9NZV6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MSRB1Q9NZV6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MSRB1Q9NZV6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MSRB1Q9NZV6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MSRB1Q9NZV6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MSRB1Q9NZV6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MSRB1Q9NZV6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MSRB1Q9NZV6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MSRB1Q9NZV6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MSRB1Q9NZV6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MSRB1Q9NZV6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MSRB1Q9NZV6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MSRB1Q9NZV6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MSRB1Q9NZV6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MSRB1Q9NZV6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MSRB1Q9NZV6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MSRB1Q9NZV6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MSRB1Q9NZV6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MSRB1Q9NZV6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MSRB1Q9NZV6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MSRB1Q9NZV6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MSRB1Q9NZV6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MSRB1Q9NZV6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MSRB1Q9NZV6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MSRB1Q9NZV6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MSRB1Q9NZV6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MSRB1Q9NZV6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
MSRB1Q9NZV6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MSRB1Q9NZV6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MSRB1Q9NZV6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MSRB1Q9NZV6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MSRB1Q9NZV6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MSRB1Q9NZV6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MSRB1Q9NZV6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MSRB1Q9NZV6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MSRB1Q9NZV6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MSRB1Q9NZV6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MSRB1Q9NZV6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MSRB1Q9NZV6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MSRB1Q9NZV6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MSRB1Q9NZV6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MSRB1Q9NZV6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MSRB1Q9NZV6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MSRB1Q9NZV6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MSRB1Q9NZV6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MSRB1Q9NZV6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MSRB1Q9NZV6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MSRB1Q9NZV6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MSRB1Q9NZV6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MSRB1Q9NZV6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
MSRB1Q9NZV6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MSRB1Q9NZV6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
MSRB1Q9NZV6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MSRB1Q9NZV6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MSRB1Q9NZV6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
MSRB1Q9NZV6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MSRB1Q9NZV6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MSRB1Q9NZV6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MSRB1Q9NZV6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MSRB1Q9NZV6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MSRB1Q9NZV6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MSRB1Q9NZV6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MSRB1Q9NZV6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MSRB1Q9NZV6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MSRB1Q9NZV6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MSRB1Q9NZV6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MSRB1Q9NZV6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MSRB1Q9NZV6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MSRB1Q9NZV6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MSRB1Q9NZV6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MSRB1Q9NZV6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MSRB1Q9NZV6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MSRB1Q9NZV6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MSRB1Q9NZV6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MSRB1Q9NZV6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MSRB1Q9NZV6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MSRB1Q9NZV6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MSRB1Q9NZV6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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