Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY12

GAR1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAR1Q9NY12 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GAR1Q9NY12 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GAR1Q9NY12 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GAR1Q9NY12 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GAR1Q9NY12 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GAR1Q9NY12 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GAR1Q9NY12 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GAR1Q9NY12 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GAR1Q9NY12 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GAR1Q9NY12 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GAR1Q9NY12 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GAR1Q9NY12 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GAR1Q9NY12 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GAR1Q9NY12 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GAR1Q9NY12 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GAR1Q9NY12 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GAR1Q9NY12 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GAR1Q9NY12 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GAR1Q9NY12 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GAR1Q9NY12 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GAR1Q9NY12 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GAR1Q9NY12 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GAR1Q9NY12 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GAR1Q9NY12 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GAR1Q9NY12 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GAR1Q9NY12 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GAR1Q9NY12 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GAR1Q9NY12 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GAR1Q9NY12 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GAR1Q9NY12 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GAR1Q9NY12 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GAR1Q9NY12 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GAR1Q9NY12 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GAR1Q9NY12 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GAR1Q9NY12 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GAR1Q9NY12 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GAR1Q9NY12 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GAR1Q9NY12 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GAR1Q9NY12 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GAR1Q9NY12 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GAR1Q9NY12 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GAR1Q9NY12 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GAR1Q9NY12 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GAR1Q9NY12 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GAR1Q9NY12 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GAR1Q9NY12 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GAR1Q9NY12 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GAR1Q9NY12 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GAR1Q9NY12 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GAR1Q9NY12 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GAR1Q9NY12 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GAR1Q9NY12 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GAR1Q9NY12 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GAR1Q9NY12 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GAR1Q9NY12 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GAR1Q9NY12 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GAR1Q9NY12 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
GAR1Q9NY12 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GAR1Q9NY12 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GAR1Q9NY12 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GAR1Q9NY12 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GAR1Q9NY12 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GAR1Q9NY12 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GAR1Q9NY12 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GAR1Q9NY12 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GAR1Q9NY12 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GAR1Q9NY12 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GAR1Q9NY12 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GAR1Q9NY12 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GAR1Q9NY12 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GAR1Q9NY12 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GAR1Q9NY12 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GAR1Q9NY12 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GAR1Q9NY12 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GAR1Q9NY12 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GAR1Q9NY12 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GAR1Q9NY12 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GAR1Q9NY12 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GAR1Q9NY12 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GAR1Q9NY12 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GAR1Q9NY12 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GAR1Q9NY12 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GAR1Q9NY12 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GAR1Q9NY12 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GAR1Q9NY12 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GAR1Q9NY12 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GAR1Q9NY12 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GAR1Q9NY12 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.33■■□□□ 1
GAR1Q9NY12 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GAR1Q9NY12 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GAR1Q9NY12 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
GAR1Q9NY12 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GAR1Q9NY12 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GAR1Q9NY12 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GAR1Q9NY12 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GAR1Q9NY12 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GAR1Q9NY12 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GAR1Q9NY12 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GAR1Q9NY12 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GAR1Q9NY12 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms