Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR1

NDE1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDE1Q9NXR1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NDE1Q9NXR1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NDE1Q9NXR1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NDE1Q9NXR1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NDE1Q9NXR1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NDE1Q9NXR1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NDE1Q9NXR1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NDE1Q9NXR1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NDE1Q9NXR1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NDE1Q9NXR1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NDE1Q9NXR1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NDE1Q9NXR1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NDE1Q9NXR1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NDE1Q9NXR1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NDE1Q9NXR1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NDE1Q9NXR1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NDE1Q9NXR1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NDE1Q9NXR1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NDE1Q9NXR1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NDE1Q9NXR1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NDE1Q9NXR1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NDE1Q9NXR1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NDE1Q9NXR1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NDE1Q9NXR1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NDE1Q9NXR1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NDE1Q9NXR1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NDE1Q9NXR1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NDE1Q9NXR1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NDE1Q9NXR1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NDE1Q9NXR1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NDE1Q9NXR1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NDE1Q9NXR1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NDE1Q9NXR1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NDE1Q9NXR1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NDE1Q9NXR1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NDE1Q9NXR1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NDE1Q9NXR1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NDE1Q9NXR1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NDE1Q9NXR1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NDE1Q9NXR1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NDE1Q9NXR1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NDE1Q9NXR1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NDE1Q9NXR1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NDE1Q9NXR1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NDE1Q9NXR1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NDE1Q9NXR1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NDE1Q9NXR1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NDE1Q9NXR1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NDE1Q9NXR1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NDE1Q9NXR1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NDE1Q9NXR1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NDE1Q9NXR1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NDE1Q9NXR1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NDE1Q9NXR1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NDE1Q9NXR1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NDE1Q9NXR1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NDE1Q9NXR1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NDE1Q9NXR1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NDE1Q9NXR1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NDE1Q9NXR1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NDE1Q9NXR1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NDE1Q9NXR1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NDE1Q9NXR1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NDE1Q9NXR1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NDE1Q9NXR1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
NDE1Q9NXR1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NDE1Q9NXR1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NDE1Q9NXR1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NDE1Q9NXR1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NDE1Q9NXR1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NDE1Q9NXR1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NDE1Q9NXR1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NDE1Q9NXR1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NDE1Q9NXR1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NDE1Q9NXR1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NDE1Q9NXR1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NDE1Q9NXR1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NDE1Q9NXR1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NDE1Q9NXR1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NDE1Q9NXR1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NDE1Q9NXR1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NDE1Q9NXR1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NDE1Q9NXR1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NDE1Q9NXR1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NDE1Q9NXR1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NDE1Q9NXR1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NDE1Q9NXR1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NDE1Q9NXR1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NDE1Q9NXR1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NDE1Q9NXR1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NDE1Q9NXR1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NDE1Q9NXR1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NDE1Q9NXR1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NDE1Q9NXR1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NDE1Q9NXR1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NDE1Q9NXR1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NDE1Q9NXR1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NDE1Q9NXR1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NDE1Q9NXR1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NDE1Q9NXR1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms