Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB1

RBFOX1, RNA binding protein fox-1 homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX1Q9NWB1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBFOX1Q9NWB1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBFOX1Q9NWB1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBFOX1Q9NWB1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBFOX1Q9NWB1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBFOX1Q9NWB1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBFOX1Q9NWB1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBFOX1Q9NWB1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBFOX1Q9NWB1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBFOX1Q9NWB1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBFOX1Q9NWB1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBFOX1Q9NWB1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBFOX1Q9NWB1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBFOX1Q9NWB1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBFOX1Q9NWB1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBFOX1Q9NWB1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RBFOX1Q9NWB1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBFOX1Q9NWB1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBFOX1Q9NWB1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBFOX1Q9NWB1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBFOX1Q9NWB1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBFOX1Q9NWB1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBFOX1Q9NWB1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBFOX1Q9NWB1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBFOX1Q9NWB1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBFOX1Q9NWB1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBFOX1Q9NWB1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBFOX1Q9NWB1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBFOX1Q9NWB1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBFOX1Q9NWB1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBFOX1Q9NWB1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBFOX1Q9NWB1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBFOX1Q9NWB1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBFOX1Q9NWB1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBFOX1Q9NWB1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBFOX1Q9NWB1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBFOX1Q9NWB1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBFOX1Q9NWB1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBFOX1Q9NWB1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBFOX1Q9NWB1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBFOX1Q9NWB1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBFOX1Q9NWB1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBFOX1Q9NWB1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBFOX1Q9NWB1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBFOX1Q9NWB1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBFOX1Q9NWB1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RBFOX1Q9NWB1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBFOX1Q9NWB1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RBFOX1Q9NWB1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBFOX1Q9NWB1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBFOX1Q9NWB1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBFOX1Q9NWB1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBFOX1Q9NWB1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBFOX1Q9NWB1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBFOX1Q9NWB1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBFOX1Q9NWB1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBFOX1Q9NWB1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBFOX1Q9NWB1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBFOX1Q9NWB1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBFOX1Q9NWB1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBFOX1Q9NWB1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBFOX1Q9NWB1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBFOX1Q9NWB1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBFOX1Q9NWB1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBFOX1Q9NWB1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBFOX1Q9NWB1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBFOX1Q9NWB1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBFOX1Q9NWB1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBFOX1Q9NWB1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBFOX1Q9NWB1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBFOX1Q9NWB1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBFOX1Q9NWB1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBFOX1Q9NWB1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBFOX1Q9NWB1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBFOX1Q9NWB1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBFOX1Q9NWB1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBFOX1Q9NWB1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBFOX1Q9NWB1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBFOX1Q9NWB1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBFOX1Q9NWB1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBFOX1Q9NWB1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RBFOX1Q9NWB1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RBFOX1Q9NWB1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBFOX1Q9NWB1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBFOX1Q9NWB1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBFOX1Q9NWB1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBFOX1Q9NWB1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBFOX1Q9NWB1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBFOX1Q9NWB1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBFOX1Q9NWB1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RBFOX1Q9NWB1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBFOX1Q9NWB1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBFOX1Q9NWB1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBFOX1Q9NWB1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RBFOX1Q9NWB1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBFOX1Q9NWB1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RBFOX1Q9NWB1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBFOX1Q9NWB1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBFOX1Q9NWB1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBFOX1Q9NWB1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms