Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
LRRC4BQ9NT99 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
LRRC4BQ9NT99 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
LRRC4BQ9NT99 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
LRRC4BQ9NT99 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC35.73■■■■□ 3.31
LRRC4BQ9NT99 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
LRRC4BQ9NT99 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
LRRC4BQ9NT99 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
LRRC4BQ9NT99 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
LRRC4BQ9NT99 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
LRRC4BQ9NT99 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
LRRC4BQ9NT99 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
LRRC4BQ9NT99 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
LRRC4BQ9NT99 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
LRRC4BQ9NT99 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
LRRC4BQ9NT99 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
LRRC4BQ9NT99 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
LRRC4BQ9NT99 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
LRRC4BQ9NT99 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
LRRC4BQ9NT99 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
LRRC4BQ9NT99 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
LRRC4BQ9NT99 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.29
LRRC4BQ9NT99 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
LRRC4BQ9NT99 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
LRRC4BQ9NT99 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
LRRC4BQ9NT99 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
LRRC4BQ9NT99 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
LRRC4BQ9NT99 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
LRRC4BQ9NT99 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
LRRC4BQ9NT99 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
LRRC4BQ9NT99 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
LRRC4BQ9NT99 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
LRRC4BQ9NT99 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
LRRC4BQ9NT99 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
LRRC4BQ9NT99 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
LRRC4BQ9NT99 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
LRRC4BQ9NT99 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
LRRC4BQ9NT99 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
LRRC4BQ9NT99 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
LRRC4BQ9NT99 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
LRRC4BQ9NT99 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
LRRC4BQ9NT99 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
LRRC4BQ9NT99 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
LRRC4BQ9NT99 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
LRRC4BQ9NT99 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
LRRC4BQ9NT99 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
LRRC4BQ9NT99 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
LRRC4BQ9NT99 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
LRRC4BQ9NT99 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
LRRC4BQ9NT99 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
LRRC4BQ9NT99 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
LRRC4BQ9NT99 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
LRRC4BQ9NT99 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
LRRC4BQ9NT99 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC35.34■■■■□ 3.25
LRRC4BQ9NT99 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC35.33■■■■□ 3.25
LRRC4BQ9NT99 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
LRRC4BQ9NT99 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
LRRC4BQ9NT99 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
LRRC4BQ9NT99 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
LRRC4BQ9NT99 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
LRRC4BQ9NT99 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
LRRC4BQ9NT99 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
LRRC4BQ9NT99 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
LRRC4BQ9NT99 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
LRRC4BQ9NT99 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
LRRC4BQ9NT99 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
LRRC4BQ9NT99 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
LRRC4BQ9NT99 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
LRRC4BQ9NT99 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
LRRC4BQ9NT99 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
LRRC4BQ9NT99 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
LRRC4BQ9NT99 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
LRRC4BQ9NT99 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
LRRC4BQ9NT99 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
LRRC4BQ9NT99 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
LRRC4BQ9NT99 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
LRRC4BQ9NT99 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
LRRC4BQ9NT99 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
LRRC4BQ9NT99 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC35.16■■■■□ 3.22
LRRC4BQ9NT99 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
LRRC4BQ9NT99 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
LRRC4BQ9NT99 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
LRRC4BQ9NT99 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
LRRC4BQ9NT99 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
LRRC4BQ9NT99 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
LRRC4BQ9NT99 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
LRRC4BQ9NT99 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
LRRC4BQ9NT99 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
LRRC4BQ9NT99 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
LRRC4BQ9NT99 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
LRRC4BQ9NT99 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
LRRC4BQ9NT99 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
LRRC4BQ9NT99 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
LRRC4BQ9NT99 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
LRRC4BQ9NT99 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
LRRC4BQ9NT99 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
LRRC4BQ9NT99 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC35.04■■■■□ 3.2
LRRC4BQ9NT99 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
LRRC4BQ9NT99 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
LRRC4BQ9NT99 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms