Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF275Q9NSD4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF275Q9NSD4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZNF275Q9NSD4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF275Q9NSD4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF275Q9NSD4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF275Q9NSD4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF275Q9NSD4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF275Q9NSD4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF275Q9NSD4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF275Q9NSD4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF275Q9NSD4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF275Q9NSD4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF275Q9NSD4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF275Q9NSD4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF275Q9NSD4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF275Q9NSD4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF275Q9NSD4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF275Q9NSD4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF275Q9NSD4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF275Q9NSD4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF275Q9NSD4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF275Q9NSD4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF275Q9NSD4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF275Q9NSD4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF275Q9NSD4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF275Q9NSD4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF275Q9NSD4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF275Q9NSD4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF275Q9NSD4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF275Q9NSD4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF275Q9NSD4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF275Q9NSD4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF275Q9NSD4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF275Q9NSD4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF275Q9NSD4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF275Q9NSD4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF275Q9NSD4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF275Q9NSD4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF275Q9NSD4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF275Q9NSD4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF275Q9NSD4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF275Q9NSD4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF275Q9NSD4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF275Q9NSD4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF275Q9NSD4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF275Q9NSD4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF275Q9NSD4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF275Q9NSD4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF275Q9NSD4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF275Q9NSD4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF275Q9NSD4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF275Q9NSD4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF275Q9NSD4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF275Q9NSD4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF275Q9NSD4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF275Q9NSD4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF275Q9NSD4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF275Q9NSD4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF275Q9NSD4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF275Q9NSD4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF275Q9NSD4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF275Q9NSD4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF275Q9NSD4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF275Q9NSD4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF275Q9NSD4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF275Q9NSD4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF275Q9NSD4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF275Q9NSD4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF275Q9NSD4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF275Q9NSD4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF275Q9NSD4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF275Q9NSD4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF275Q9NSD4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF275Q9NSD4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF275Q9NSD4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF275Q9NSD4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF275Q9NSD4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF275Q9NSD4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF275Q9NSD4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF275Q9NSD4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF275Q9NSD4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF275Q9NSD4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF275Q9NSD4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF275Q9NSD4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF275Q9NSD4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF275Q9NSD4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF275Q9NSD4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF275Q9NSD4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF275Q9NSD4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF275Q9NSD4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF275Q9NSD4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF275Q9NSD4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF275Q9NSD4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF275Q9NSD4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF275Q9NSD4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF275Q9NSD4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF275Q9NSD4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF275Q9NSD4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF275Q9NSD4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms