Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
LTBP3Q9NS15 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
LTBP3Q9NS15 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
LTBP3Q9NS15 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
LTBP3Q9NS15 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
LTBP3Q9NS15 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
LTBP3Q9NS15 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
LTBP3Q9NS15 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
LTBP3Q9NS15 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
LTBP3Q9NS15 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.92■■■■□ 3.02
LTBP3Q9NS15 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
LTBP3Q9NS15 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
LTBP3Q9NS15 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
LTBP3Q9NS15 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
LTBP3Q9NS15 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
LTBP3Q9NS15 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
LTBP3Q9NS15 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
LTBP3Q9NS15 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
LTBP3Q9NS15 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
LTBP3Q9NS15 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
LTBP3Q9NS15 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
LTBP3Q9NS15 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
LTBP3Q9NS15 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
LTBP3Q9NS15 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
LTBP3Q9NS15 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
LTBP3Q9NS15 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
LTBP3Q9NS15 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
LTBP3Q9NS15 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
LTBP3Q9NS15 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
LTBP3Q9NS15 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
LTBP3Q9NS15 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
LTBP3Q9NS15 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
LTBP3Q9NS15 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
LTBP3Q9NS15 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
LTBP3Q9NS15 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
LTBP3Q9NS15 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
LTBP3Q9NS15 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
LTBP3Q9NS15 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
LTBP3Q9NS15 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
LTBP3Q9NS15 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
LTBP3Q9NS15 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
LTBP3Q9NS15 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
LTBP3Q9NS15 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
LTBP3Q9NS15 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
LTBP3Q9NS15 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
LTBP3Q9NS15 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
LTBP3Q9NS15 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
LTBP3Q9NS15 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
LTBP3Q9NS15 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
LTBP3Q9NS15 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
LTBP3Q9NS15 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
LTBP3Q9NS15 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
LTBP3Q9NS15 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.59■■■□□ 2.97
LTBP3Q9NS15 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
LTBP3Q9NS15 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
LTBP3Q9NS15 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LTBP3Q9NS15 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LTBP3Q9NS15 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
LTBP3Q9NS15 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
LTBP3Q9NS15 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
LTBP3Q9NS15 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
LTBP3Q9NS15 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.54■■■□□ 2.96
LTBP3Q9NS15 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LTBP3Q9NS15 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LTBP3Q9NS15 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LTBP3Q9NS15 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
LTBP3Q9NS15 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
LTBP3Q9NS15 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
LTBP3Q9NS15 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
LTBP3Q9NS15 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
LTBP3Q9NS15 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
LTBP3Q9NS15 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
LTBP3Q9NS15 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
LTBP3Q9NS15 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
LTBP3Q9NS15 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
LTBP3Q9NS15 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC33.44■■■□□ 2.94
LTBP3Q9NS15 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
LTBP3Q9NS15 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
LTBP3Q9NS15 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
LTBP3Q9NS15 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
LTBP3Q9NS15 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
LTBP3Q9NS15 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
LTBP3Q9NS15 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
LTBP3Q9NS15 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
LTBP3Q9NS15 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
LTBP3Q9NS15 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
LTBP3Q9NS15 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
LTBP3Q9NS15 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
LTBP3Q9NS15 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
LTBP3Q9NS15 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
LTBP3Q9NS15 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LTBP3Q9NS15 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LTBP3Q9NS15 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
LTBP3Q9NS15 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
LTBP3Q9NS15 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
LTBP3Q9NS15 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.93
LTBP3Q9NS15 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
LTBP3Q9NS15 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
LTBP3Q9NS15 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
LTBP3Q9NS15 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms