Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP74

PALMD, Palmdelphin, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALMDQ9NP74 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PALMDQ9NP74 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PALMDQ9NP74 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PALMDQ9NP74 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PALMDQ9NP74 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PALMDQ9NP74 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALMDQ9NP74 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALMDQ9NP74 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALMDQ9NP74 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALMDQ9NP74 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALMDQ9NP74 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALMDQ9NP74 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALMDQ9NP74 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALMDQ9NP74 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALMDQ9NP74 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALMDQ9NP74 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALMDQ9NP74 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALMDQ9NP74 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALMDQ9NP74 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALMDQ9NP74 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALMDQ9NP74 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALMDQ9NP74 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALMDQ9NP74 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PALMDQ9NP74 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PALMDQ9NP74 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PALMDQ9NP74 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PALMDQ9NP74 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALMDQ9NP74 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALMDQ9NP74 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALMDQ9NP74 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PALMDQ9NP74 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PALMDQ9NP74 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PALMDQ9NP74 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PALMDQ9NP74 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PALMDQ9NP74 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PALMDQ9NP74 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PALMDQ9NP74 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PALMDQ9NP74 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PALMDQ9NP74 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PALMDQ9NP74 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PALMDQ9NP74 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PALMDQ9NP74 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PALMDQ9NP74 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PALMDQ9NP74 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PALMDQ9NP74 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PALMDQ9NP74 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PALMDQ9NP74 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PALMDQ9NP74 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALMDQ9NP74 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALMDQ9NP74 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALMDQ9NP74 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PALMDQ9NP74 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALMDQ9NP74 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALMDQ9NP74 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALMDQ9NP74 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALMDQ9NP74 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALMDQ9NP74 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALMDQ9NP74 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALMDQ9NP74 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALMDQ9NP74 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALMDQ9NP74 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALMDQ9NP74 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALMDQ9NP74 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PALMDQ9NP74 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PALMDQ9NP74 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PALMDQ9NP74 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALMDQ9NP74 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PALMDQ9NP74 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PALMDQ9NP74 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PALMDQ9NP74 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PALMDQ9NP74 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PALMDQ9NP74 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PALMDQ9NP74 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PALMDQ9NP74 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PALMDQ9NP74 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PALMDQ9NP74 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALMDQ9NP74 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PALMDQ9NP74 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PALMDQ9NP74 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PALMDQ9NP74 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALMDQ9NP74 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALMDQ9NP74 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALMDQ9NP74 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALMDQ9NP74 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PALMDQ9NP74 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PALMDQ9NP74 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PALMDQ9NP74 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALMDQ9NP74 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALMDQ9NP74 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALMDQ9NP74 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALMDQ9NP74 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALMDQ9NP74 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALMDQ9NP74 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PALMDQ9NP74 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PALMDQ9NP74 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PALMDQ9NP74 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALMDQ9NP74 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PALMDQ9NP74 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PALMDQ9NP74 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PALMDQ9NP74 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms