Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC29

NOD2, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD2Q9HC29 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NOD2Q9HC29 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NOD2Q9HC29 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NOD2Q9HC29 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NOD2Q9HC29 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NOD2Q9HC29 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NOD2Q9HC29 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NOD2Q9HC29 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NOD2Q9HC29 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NOD2Q9HC29 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NOD2Q9HC29 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NOD2Q9HC29 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NOD2Q9HC29 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NOD2Q9HC29 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NOD2Q9HC29 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NOD2Q9HC29 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NOD2Q9HC29 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NOD2Q9HC29 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NOD2Q9HC29 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NOD2Q9HC29 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NOD2Q9HC29 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NOD2Q9HC29 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NOD2Q9HC29 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NOD2Q9HC29 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NOD2Q9HC29 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NOD2Q9HC29 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NOD2Q9HC29 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NOD2Q9HC29 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NOD2Q9HC29 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NOD2Q9HC29 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NOD2Q9HC29 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NOD2Q9HC29 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NOD2Q9HC29 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NOD2Q9HC29 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NOD2Q9HC29 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NOD2Q9HC29 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NOD2Q9HC29 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NOD2Q9HC29 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NOD2Q9HC29 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NOD2Q9HC29 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NOD2Q9HC29 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NOD2Q9HC29 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NOD2Q9HC29 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NOD2Q9HC29 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NOD2Q9HC29 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NOD2Q9HC29 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NOD2Q9HC29 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NOD2Q9HC29 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NOD2Q9HC29 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NOD2Q9HC29 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NOD2Q9HC29 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NOD2Q9HC29 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NOD2Q9HC29 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NOD2Q9HC29 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NOD2Q9HC29 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NOD2Q9HC29 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NOD2Q9HC29 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NOD2Q9HC29 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NOD2Q9HC29 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NOD2Q9HC29 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NOD2Q9HC29 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NOD2Q9HC29 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NOD2Q9HC29 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NOD2Q9HC29 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NOD2Q9HC29 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NOD2Q9HC29 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NOD2Q9HC29 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NOD2Q9HC29 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NOD2Q9HC29 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NOD2Q9HC29 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NOD2Q9HC29 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NOD2Q9HC29 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NOD2Q9HC29 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NOD2Q9HC29 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NOD2Q9HC29 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NOD2Q9HC29 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
NOD2Q9HC29 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NOD2Q9HC29 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NOD2Q9HC29 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NOD2Q9HC29 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NOD2Q9HC29 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NOD2Q9HC29 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NOD2Q9HC29 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NOD2Q9HC29 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NOD2Q9HC29 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NOD2Q9HC29 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NOD2Q9HC29 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NOD2Q9HC29 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NOD2Q9HC29 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NOD2Q9HC29 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NOD2Q9HC29 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
NOD2Q9HC29 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NOD2Q9HC29 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NOD2Q9HC29 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NOD2Q9HC29 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NOD2Q9HC29 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NOD2Q9HC29 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NOD2Q9HC29 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NOD2Q9HC29 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NOD2Q9HC29 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms