Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTDSP1Q9GZU7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTDSP1Q9GZU7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTDSP1Q9GZU7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTDSP1Q9GZU7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTDSP1Q9GZU7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTDSP1Q9GZU7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTDSP1Q9GZU7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTDSP1Q9GZU7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTDSP1Q9GZU7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTDSP1Q9GZU7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTDSP1Q9GZU7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTDSP1Q9GZU7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTDSP1Q9GZU7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTDSP1Q9GZU7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTDSP1Q9GZU7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTDSP1Q9GZU7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTDSP1Q9GZU7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTDSP1Q9GZU7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTDSP1Q9GZU7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTDSP1Q9GZU7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSP1Q9GZU7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTDSP1Q9GZU7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSP1Q9GZU7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSP1Q9GZU7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSP1Q9GZU7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSP1Q9GZU7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CTDSP1Q9GZU7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTDSP1Q9GZU7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTDSP1Q9GZU7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTDSP1Q9GZU7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTDSP1Q9GZU7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTDSP1Q9GZU7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTDSP1Q9GZU7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CTDSP1Q9GZU7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTDSP1Q9GZU7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTDSP1Q9GZU7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTDSP1Q9GZU7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTDSP1Q9GZU7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTDSP1Q9GZU7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CTDSP1Q9GZU7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTDSP1Q9GZU7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTDSP1Q9GZU7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CTDSP1Q9GZU7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTDSP1Q9GZU7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTDSP1Q9GZU7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTDSP1Q9GZU7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTDSP1Q9GZU7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTDSP1Q9GZU7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTDSP1Q9GZU7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTDSP1Q9GZU7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTDSP1Q9GZU7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTDSP1Q9GZU7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTDSP1Q9GZU7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTDSP1Q9GZU7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTDSP1Q9GZU7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTDSP1Q9GZU7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTDSP1Q9GZU7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTDSP1Q9GZU7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTDSP1Q9GZU7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTDSP1Q9GZU7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTDSP1Q9GZU7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTDSP1Q9GZU7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTDSP1Q9GZU7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTDSP1Q9GZU7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTDSP1Q9GZU7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTDSP1Q9GZU7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTDSP1Q9GZU7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTDSP1Q9GZU7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTDSP1Q9GZU7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTDSP1Q9GZU7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTDSP1Q9GZU7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTDSP1Q9GZU7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTDSP1Q9GZU7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTDSP1Q9GZU7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTDSP1Q9GZU7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTDSP1Q9GZU7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTDSP1Q9GZU7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTDSP1Q9GZU7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTDSP1Q9GZU7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTDSP1Q9GZU7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTDSP1Q9GZU7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTDSP1Q9GZU7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTDSP1Q9GZU7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTDSP1Q9GZU7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTDSP1Q9GZU7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTDSP1Q9GZU7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTDSP1Q9GZU7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTDSP1Q9GZU7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTDSP1Q9GZU7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTDSP1Q9GZU7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTDSP1Q9GZU7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTDSP1Q9GZU7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTDSP1Q9GZU7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTDSP1Q9GZU7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTDSP1Q9GZU7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTDSP1Q9GZU7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTDSP1Q9GZU7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTDSP1Q9GZU7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTDSP1Q9GZU7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms