Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
LRRCC1Q9C099 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
LRRCC1Q9C099 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
LRRCC1Q9C099 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
LRRCC1Q9C099 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LRRCC1Q9C099 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LRRCC1Q9C099 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
LRRCC1Q9C099 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
LRRCC1Q9C099 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
LRRCC1Q9C099 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
LRRCC1Q9C099 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LRRCC1Q9C099 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
LRRCC1Q9C099 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
LRRCC1Q9C099 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
LRRCC1Q9C099 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
LRRCC1Q9C099 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
LRRCC1Q9C099 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
LRRCC1Q9C099 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
LRRCC1Q9C099 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
LRRCC1Q9C099 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
LRRCC1Q9C099 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
LRRCC1Q9C099 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
LRRCC1Q9C099 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
LRRCC1Q9C099 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
LRRCC1Q9C099 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
LRRCC1Q9C099 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
LRRCC1Q9C099 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
LRRCC1Q9C099 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
LRRCC1Q9C099 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
LRRCC1Q9C099 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
LRRCC1Q9C099 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
LRRCC1Q9C099 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
LRRCC1Q9C099 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
LRRCC1Q9C099 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
LRRCC1Q9C099 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
LRRCC1Q9C099 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
LRRCC1Q9C099 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LRRCC1Q9C099 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
LRRCC1Q9C099 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
LRRCC1Q9C099 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
LRRCC1Q9C099 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
LRRCC1Q9C099 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
LRRCC1Q9C099 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
LRRCC1Q9C099 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
LRRCC1Q9C099 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
LRRCC1Q9C099 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
LRRCC1Q9C099 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LRRCC1Q9C099 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
LRRCC1Q9C099 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
LRRCC1Q9C099 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
LRRCC1Q9C099 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
LRRCC1Q9C099 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
LRRCC1Q9C099 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
LRRCC1Q9C099 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
LRRCC1Q9C099 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
LRRCC1Q9C099 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
LRRCC1Q9C099 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
LRRCC1Q9C099 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
LRRCC1Q9C099 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
LRRCC1Q9C099 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
LRRCC1Q9C099 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
LRRCC1Q9C099 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
LRRCC1Q9C099 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
LRRCC1Q9C099 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
LRRCC1Q9C099 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
LRRCC1Q9C099 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
LRRCC1Q9C099 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
LRRCC1Q9C099 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
LRRCC1Q9C099 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
LRRCC1Q9C099 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
LRRCC1Q9C099 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
LRRCC1Q9C099 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
LRRCC1Q9C099 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
LRRCC1Q9C099 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
LRRCC1Q9C099 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
LRRCC1Q9C099 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
LRRCC1Q9C099 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
LRRCC1Q9C099 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
LRRCC1Q9C099 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
LRRCC1Q9C099 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
LRRCC1Q9C099 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
LRRCC1Q9C099 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
LRRCC1Q9C099 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
LRRCC1Q9C099 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
LRRCC1Q9C099 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
LRRCC1Q9C099 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
LRRCC1Q9C099 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
LRRCC1Q9C099 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
LRRCC1Q9C099 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
LRRCC1Q9C099 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
LRRCC1Q9C099 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
LRRCC1Q9C099 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
LRRCC1Q9C099 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
LRRCC1Q9C099 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
LRRCC1Q9C099 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
LRRCC1Q9C099 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
LRRCC1Q9C099 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
LRRCC1Q9C099 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
LRRCC1Q9C099 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
LRRCC1Q9C099 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms