Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
SYCP2Q9BX26 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
SYCP2Q9BX26 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC41.89■■■■■ 4.3
SYCP2Q9BX26 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC41.89■■■■■ 4.3
SYCP2Q9BX26 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC41.88■■■■■ 4.29
SYCP2Q9BX26 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
SYCP2Q9BX26 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
SYCP2Q9BX26 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
SYCP2Q9BX26 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
SYCP2Q9BX26 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
SYCP2Q9BX26 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
SYCP2Q9BX26 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
SYCP2Q9BX26 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
SYCP2Q9BX26 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
SYCP2Q9BX26 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
SYCP2Q9BX26 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
SYCP2Q9BX26 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
SYCP2Q9BX26 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC41.78■■■■■ 4.28
SYCP2Q9BX26 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC41.78■■■■■ 4.28
SYCP2Q9BX26 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
SYCP2Q9BX26 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
SYCP2Q9BX26 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
SYCP2Q9BX26 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC41.73■■■■■ 4.27
SYCP2Q9BX26 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
SYCP2Q9BX26 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
SYCP2Q9BX26 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
SYCP2Q9BX26 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC41.71■■■■■ 4.27
SYCP2Q9BX26 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
SYCP2Q9BX26 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
SYCP2Q9BX26 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC41.69■■■■■ 4.27
SYCP2Q9BX26 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
SYCP2Q9BX26 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
SYCP2Q9BX26 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
SYCP2Q9BX26 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC41.65■■■■■ 4.26
SYCP2Q9BX26 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
SYCP2Q9BX26 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC41.64■■■■■ 4.26
SYCP2Q9BX26 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
SYCP2Q9BX26 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
SYCP2Q9BX26 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC41.61■■■■■ 4.25
SYCP2Q9BX26 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC41.61■■■■■ 4.25
SYCP2Q9BX26 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC41.6■■■■■ 4.25
SYCP2Q9BX26 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC41.6■■■■■ 4.25
SYCP2Q9BX26 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
SYCP2Q9BX26 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
SYCP2Q9BX26 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
SYCP2Q9BX26 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.24
SYCP2Q9BX26 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
SYCP2Q9BX26 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
SYCP2Q9BX26 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC41.54■■■■■ 4.24
SYCP2Q9BX26 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
SYCP2Q9BX26 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC41.51■■■■■ 4.24
SYCP2Q9BX26 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
SYCP2Q9BX26 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
SYCP2Q9BX26 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.49■■■■■ 4.23
SYCP2Q9BX26 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
SYCP2Q9BX26 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
SYCP2Q9BX26 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC41.44■■■■■ 4.23
SYCP2Q9BX26 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
SYCP2Q9BX26 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
SYCP2Q9BX26 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC41.42■■■■■ 4.22
SYCP2Q9BX26 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
SYCP2Q9BX26 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
SYCP2Q9BX26 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
SYCP2Q9BX26 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC41.37■■■■■ 4.21
SYCP2Q9BX26 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
SYCP2Q9BX26 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
SYCP2Q9BX26 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
SYCP2Q9BX26 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
SYCP2Q9BX26 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
SYCP2Q9BX26 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
SYCP2Q9BX26 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
SYCP2Q9BX26 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
SYCP2Q9BX26 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
SYCP2Q9BX26 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.21
SYCP2Q9BX26 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
SYCP2Q9BX26 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
SYCP2Q9BX26 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
SYCP2Q9BX26 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
SYCP2Q9BX26 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
SYCP2Q9BX26 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC41.28■■■■■ 4.2
SYCP2Q9BX26 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
SYCP2Q9BX26 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
SYCP2Q9BX26 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.19
SYCP2Q9BX26 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
SYCP2Q9BX26 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC41.24■■■■■ 4.19
SYCP2Q9BX26 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.23■■■■■ 4.19
SYCP2Q9BX26 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
SYCP2Q9BX26 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
SYCP2Q9BX26 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
SYCP2Q9BX26 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
SYCP2Q9BX26 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC41.19■■■■■ 4.18
SYCP2Q9BX26 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC41.18■■■■■ 4.18
SYCP2Q9BX26 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
SYCP2Q9BX26 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
SYCP2Q9BX26 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
SYCP2Q9BX26 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
SYCP2Q9BX26 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
SYCP2Q9BX26 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
SYCP2Q9BX26 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
SYCP2Q9BX26 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms