Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUL5

PHF23, PHD finger protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF23Q9BUL5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
PHF23Q9BUL5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
PHF23Q9BUL5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
PHF23Q9BUL5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
PHF23Q9BUL5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
PHF23Q9BUL5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
PHF23Q9BUL5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
PHF23Q9BUL5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
PHF23Q9BUL5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
PHF23Q9BUL5 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
PHF23Q9BUL5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
PHF23Q9BUL5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
PHF23Q9BUL5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
PHF23Q9BUL5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
PHF23Q9BUL5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
PHF23Q9BUL5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
PHF23Q9BUL5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
PHF23Q9BUL5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
PHF23Q9BUL5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
PHF23Q9BUL5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
PHF23Q9BUL5 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
PHF23Q9BUL5 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
PHF23Q9BUL5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
PHF23Q9BUL5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC38.36■■■■□ 3.73
PHF23Q9BUL5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
PHF23Q9BUL5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
PHF23Q9BUL5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
PHF23Q9BUL5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
PHF23Q9BUL5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
PHF23Q9BUL5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
PHF23Q9BUL5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
PHF23Q9BUL5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC38.31■■■■□ 3.72
PHF23Q9BUL5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
PHF23Q9BUL5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
PHF23Q9BUL5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
PHF23Q9BUL5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
PHF23Q9BUL5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
PHF23Q9BUL5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
PHF23Q9BUL5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
PHF23Q9BUL5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
PHF23Q9BUL5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
PHF23Q9BUL5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
PHF23Q9BUL5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC38.21■■■■□ 3.71
PHF23Q9BUL5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC38.2■■■■□ 3.71
PHF23Q9BUL5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
PHF23Q9BUL5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
PHF23Q9BUL5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
PHF23Q9BUL5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
PHF23Q9BUL5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
PHF23Q9BUL5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
PHF23Q9BUL5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
PHF23Q9BUL5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
PHF23Q9BUL5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
PHF23Q9BUL5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
PHF23Q9BUL5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
PHF23Q9BUL5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
PHF23Q9BUL5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
PHF23Q9BUL5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
PHF23Q9BUL5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
PHF23Q9BUL5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC38.1■■■■□ 3.69
PHF23Q9BUL5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
PHF23Q9BUL5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
PHF23Q9BUL5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
PHF23Q9BUL5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
PHF23Q9BUL5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
PHF23Q9BUL5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
PHF23Q9BUL5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
PHF23Q9BUL5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC38.07■■■■□ 3.68
PHF23Q9BUL5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
PHF23Q9BUL5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
PHF23Q9BUL5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
PHF23Q9BUL5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
PHF23Q9BUL5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
PHF23Q9BUL5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
PHF23Q9BUL5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
PHF23Q9BUL5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC38■■■■□ 3.67
PHF23Q9BUL5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC37.99■■■■□ 3.67
PHF23Q9BUL5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
PHF23Q9BUL5 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
PHF23Q9BUL5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
PHF23Q9BUL5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
PHF23Q9BUL5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
PHF23Q9BUL5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
PHF23Q9BUL5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
PHF23Q9BUL5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
PHF23Q9BUL5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
PHF23Q9BUL5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
PHF23Q9BUL5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
PHF23Q9BUL5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
PHF23Q9BUL5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
PHF23Q9BUL5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
PHF23Q9BUL5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
PHF23Q9BUL5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
PHF23Q9BUL5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
PHF23Q9BUL5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
PHF23Q9BUL5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
PHF23Q9BUL5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
PHF23Q9BUL5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PHF23Q9BUL5 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PHF23Q9BUL5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms