Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR46

C20orf78, Putative uncharacterized protein C20orf78, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf78Q9BR46 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C20orf78Q9BR46 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C20orf78Q9BR46 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C20orf78Q9BR46 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C20orf78Q9BR46 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C20orf78Q9BR46 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C20orf78Q9BR46 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C20orf78Q9BR46 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C20orf78Q9BR46 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C20orf78Q9BR46 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C20orf78Q9BR46 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C20orf78Q9BR46 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C20orf78Q9BR46 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C20orf78Q9BR46 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C20orf78Q9BR46 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C20orf78Q9BR46 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C20orf78Q9BR46 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C20orf78Q9BR46 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C20orf78Q9BR46 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C20orf78Q9BR46 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C20orf78Q9BR46 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
C20orf78Q9BR46 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C20orf78Q9BR46 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C20orf78Q9BR46 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C20orf78Q9BR46 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C20orf78Q9BR46 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C20orf78Q9BR46 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
C20orf78Q9BR46 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
C20orf78Q9BR46 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
C20orf78Q9BR46 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
C20orf78Q9BR46 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
C20orf78Q9BR46 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
C20orf78Q9BR46 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C20orf78Q9BR46 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C20orf78Q9BR46 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C20orf78Q9BR46 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C20orf78Q9BR46 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C20orf78Q9BR46 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C20orf78Q9BR46 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C20orf78Q9BR46 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C20orf78Q9BR46 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C20orf78Q9BR46 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C20orf78Q9BR46 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C20orf78Q9BR46 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
C20orf78Q9BR46 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
C20orf78Q9BR46 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
C20orf78Q9BR46 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C20orf78Q9BR46 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C20orf78Q9BR46 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C20orf78Q9BR46 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C20orf78Q9BR46 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C20orf78Q9BR46 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C20orf78Q9BR46 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C20orf78Q9BR46 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C20orf78Q9BR46 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C20orf78Q9BR46 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C20orf78Q9BR46 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C20orf78Q9BR46 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C20orf78Q9BR46 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C20orf78Q9BR46 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C20orf78Q9BR46 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C20orf78Q9BR46 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C20orf78Q9BR46 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C20orf78Q9BR46 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
C20orf78Q9BR46 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C20orf78Q9BR46 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C20orf78Q9BR46 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C20orf78Q9BR46 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C20orf78Q9BR46 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C20orf78Q9BR46 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C20orf78Q9BR46 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C20orf78Q9BR46 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C20orf78Q9BR46 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C20orf78Q9BR46 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C20orf78Q9BR46 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C20orf78Q9BR46 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C20orf78Q9BR46 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C20orf78Q9BR46 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C20orf78Q9BR46 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C20orf78Q9BR46 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C20orf78Q9BR46 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C20orf78Q9BR46 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C20orf78Q9BR46 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C20orf78Q9BR46 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C20orf78Q9BR46 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
C20orf78Q9BR46 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C20orf78Q9BR46 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C20orf78Q9BR46 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C20orf78Q9BR46 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C20orf78Q9BR46 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C20orf78Q9BR46 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C20orf78Q9BR46 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C20orf78Q9BR46 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C20orf78Q9BR46 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C20orf78Q9BR46 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C20orf78Q9BR46 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C20orf78Q9BR46 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C20orf78Q9BR46 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C20orf78Q9BR46 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C20orf78Q9BR46 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms