Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RUFY1Q96T51 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RUFY1Q96T51 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RUFY1Q96T51 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RUFY1Q96T51 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RUFY1Q96T51 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RUFY1Q96T51 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RUFY1Q96T51 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RUFY1Q96T51 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RUFY1Q96T51 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RUFY1Q96T51 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RUFY1Q96T51 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RUFY1Q96T51 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RUFY1Q96T51 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RUFY1Q96T51 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RUFY1Q96T51 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RUFY1Q96T51 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RUFY1Q96T51 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RUFY1Q96T51 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RUFY1Q96T51 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RUFY1Q96T51 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RUFY1Q96T51 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RUFY1Q96T51 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RUFY1Q96T51 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RUFY1Q96T51 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RUFY1Q96T51 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RUFY1Q96T51 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RUFY1Q96T51 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RUFY1Q96T51 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RUFY1Q96T51 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RUFY1Q96T51 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RUFY1Q96T51 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RUFY1Q96T51 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RUFY1Q96T51 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RUFY1Q96T51 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RUFY1Q96T51 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RUFY1Q96T51 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RUFY1Q96T51 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RUFY1Q96T51 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RUFY1Q96T51 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RUFY1Q96T51 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RUFY1Q96T51 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RUFY1Q96T51 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RUFY1Q96T51 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RUFY1Q96T51 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RUFY1Q96T51 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RUFY1Q96T51 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RUFY1Q96T51 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RUFY1Q96T51 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RUFY1Q96T51 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RUFY1Q96T51 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
RUFY1Q96T51 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RUFY1Q96T51 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RUFY1Q96T51 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RUFY1Q96T51 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RUFY1Q96T51 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RUFY1Q96T51 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RUFY1Q96T51 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RUFY1Q96T51 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RUFY1Q96T51 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RUFY1Q96T51 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RUFY1Q96T51 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RUFY1Q96T51 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RUFY1Q96T51 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RUFY1Q96T51 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RUFY1Q96T51 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RUFY1Q96T51 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RUFY1Q96T51 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RUFY1Q96T51 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RUFY1Q96T51 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RUFY1Q96T51 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RUFY1Q96T51 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RUFY1Q96T51 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RUFY1Q96T51 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RUFY1Q96T51 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RUFY1Q96T51 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RUFY1Q96T51 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RUFY1Q96T51 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RUFY1Q96T51 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RUFY1Q96T51 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RUFY1Q96T51 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RUFY1Q96T51 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RUFY1Q96T51 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RUFY1Q96T51 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RUFY1Q96T51 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RUFY1Q96T51 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RUFY1Q96T51 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RUFY1Q96T51 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RUFY1Q96T51 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RUFY1Q96T51 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RUFY1Q96T51 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RUFY1Q96T51 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RUFY1Q96T51 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RUFY1Q96T51 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RUFY1Q96T51 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RUFY1Q96T51 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RUFY1Q96T51 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RUFY1Q96T51 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RUFY1Q96T51 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RUFY1Q96T51 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms