Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY9

MUS81, Crossover junction endonuclease MUS81, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUS81Q96NY9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MUS81Q96NY9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MUS81Q96NY9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MUS81Q96NY9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MUS81Q96NY9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MUS81Q96NY9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MUS81Q96NY9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MUS81Q96NY9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MUS81Q96NY9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MUS81Q96NY9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MUS81Q96NY9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MUS81Q96NY9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MUS81Q96NY9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MUS81Q96NY9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MUS81Q96NY9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MUS81Q96NY9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MUS81Q96NY9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MUS81Q96NY9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MUS81Q96NY9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MUS81Q96NY9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MUS81Q96NY9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MUS81Q96NY9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MUS81Q96NY9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MUS81Q96NY9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MUS81Q96NY9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MUS81Q96NY9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MUS81Q96NY9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MUS81Q96NY9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MUS81Q96NY9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MUS81Q96NY9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MUS81Q96NY9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MUS81Q96NY9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MUS81Q96NY9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MUS81Q96NY9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MUS81Q96NY9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MUS81Q96NY9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MUS81Q96NY9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MUS81Q96NY9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MUS81Q96NY9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MUS81Q96NY9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MUS81Q96NY9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MUS81Q96NY9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MUS81Q96NY9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MUS81Q96NY9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MUS81Q96NY9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MUS81Q96NY9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MUS81Q96NY9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MUS81Q96NY9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MUS81Q96NY9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MUS81Q96NY9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MUS81Q96NY9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MUS81Q96NY9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MUS81Q96NY9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MUS81Q96NY9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MUS81Q96NY9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MUS81Q96NY9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MUS81Q96NY9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MUS81Q96NY9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MUS81Q96NY9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MUS81Q96NY9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MUS81Q96NY9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MUS81Q96NY9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MUS81Q96NY9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MUS81Q96NY9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MUS81Q96NY9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MUS81Q96NY9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MUS81Q96NY9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MUS81Q96NY9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MUS81Q96NY9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MUS81Q96NY9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MUS81Q96NY9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MUS81Q96NY9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MUS81Q96NY9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MUS81Q96NY9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MUS81Q96NY9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MUS81Q96NY9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MUS81Q96NY9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MUS81Q96NY9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MUS81Q96NY9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MUS81Q96NY9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MUS81Q96NY9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MUS81Q96NY9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MUS81Q96NY9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MUS81Q96NY9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MUS81Q96NY9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MUS81Q96NY9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MUS81Q96NY9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
MUS81Q96NY9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MUS81Q96NY9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MUS81Q96NY9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MUS81Q96NY9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MUS81Q96NY9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MUS81Q96NY9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MUS81Q96NY9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MUS81Q96NY9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MUS81Q96NY9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MUS81Q96NY9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MUS81Q96NY9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MUS81Q96NY9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MUS81Q96NY9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms