Protein–RNA interactions for Protein: Q96N53

LINC00167, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00167, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00167Q96N53 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00167Q96N53 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00167Q96N53 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00167Q96N53 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00167Q96N53 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00167Q96N53 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00167Q96N53 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00167Q96N53 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00167Q96N53 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00167Q96N53 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00167Q96N53 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00167Q96N53 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00167Q96N53 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00167Q96N53 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00167Q96N53 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00167Q96N53 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00167Q96N53 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00167Q96N53 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00167Q96N53 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00167Q96N53 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00167Q96N53 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00167Q96N53 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00167Q96N53 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00167Q96N53 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00167Q96N53 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00167Q96N53 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00167Q96N53 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00167Q96N53 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00167Q96N53 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00167Q96N53 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00167Q96N53 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00167Q96N53 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00167Q96N53 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00167Q96N53 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00167Q96N53 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00167Q96N53 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00167Q96N53 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00167Q96N53 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00167Q96N53 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00167Q96N53 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00167Q96N53 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00167Q96N53 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00167Q96N53 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00167Q96N53 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00167Q96N53 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00167Q96N53 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00167Q96N53 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00167Q96N53 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00167Q96N53 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00167Q96N53 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00167Q96N53 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00167Q96N53 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00167Q96N53 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00167Q96N53 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00167Q96N53 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00167Q96N53 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00167Q96N53 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00167Q96N53 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00167Q96N53 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00167Q96N53 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00167Q96N53 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00167Q96N53 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00167Q96N53 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00167Q96N53 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00167Q96N53 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00167Q96N53 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00167Q96N53 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00167Q96N53 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00167Q96N53 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00167Q96N53 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00167Q96N53 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00167Q96N53 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00167Q96N53 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00167Q96N53 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00167Q96N53 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00167Q96N53 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00167Q96N53 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00167Q96N53 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00167Q96N53 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00167Q96N53 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00167Q96N53 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00167Q96N53 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00167Q96N53 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00167Q96N53 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00167Q96N53 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00167Q96N53 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00167Q96N53 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00167Q96N53 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00167Q96N53 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00167Q96N53 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00167Q96N53 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00167Q96N53 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00167Q96N53 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00167Q96N53 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00167Q96N53 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00167Q96N53 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00167Q96N53 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00167Q96N53 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00167Q96N53 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00167Q96N53 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms