Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR6

CFAP57, Cilia- and flagella-associated protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP57Q96MR6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFAP57Q96MR6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFAP57Q96MR6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFAP57Q96MR6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFAP57Q96MR6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFAP57Q96MR6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFAP57Q96MR6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CFAP57Q96MR6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFAP57Q96MR6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CFAP57Q96MR6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CFAP57Q96MR6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CFAP57Q96MR6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFAP57Q96MR6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CFAP57Q96MR6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CFAP57Q96MR6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CFAP57Q96MR6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFAP57Q96MR6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFAP57Q96MR6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFAP57Q96MR6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFAP57Q96MR6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFAP57Q96MR6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFAP57Q96MR6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFAP57Q96MR6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CFAP57Q96MR6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CFAP57Q96MR6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFAP57Q96MR6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CFAP57Q96MR6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CFAP57Q96MR6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CFAP57Q96MR6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFAP57Q96MR6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFAP57Q96MR6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFAP57Q96MR6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFAP57Q96MR6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFAP57Q96MR6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CFAP57Q96MR6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CFAP57Q96MR6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CFAP57Q96MR6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CFAP57Q96MR6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CFAP57Q96MR6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CFAP57Q96MR6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CFAP57Q96MR6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CFAP57Q96MR6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CFAP57Q96MR6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CFAP57Q96MR6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CFAP57Q96MR6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CFAP57Q96MR6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFAP57Q96MR6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFAP57Q96MR6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFAP57Q96MR6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CFAP57Q96MR6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFAP57Q96MR6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CFAP57Q96MR6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP57Q96MR6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP57Q96MR6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CFAP57Q96MR6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFAP57Q96MR6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CFAP57Q96MR6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFAP57Q96MR6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFAP57Q96MR6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFAP57Q96MR6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFAP57Q96MR6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFAP57Q96MR6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP57Q96MR6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP57Q96MR6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFAP57Q96MR6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFAP57Q96MR6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CFAP57Q96MR6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CFAP57Q96MR6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CFAP57Q96MR6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFAP57Q96MR6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CFAP57Q96MR6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CFAP57Q96MR6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFAP57Q96MR6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CFAP57Q96MR6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CFAP57Q96MR6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CFAP57Q96MR6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CFAP57Q96MR6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CFAP57Q96MR6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFAP57Q96MR6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFAP57Q96MR6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFAP57Q96MR6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFAP57Q96MR6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CFAP57Q96MR6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CFAP57Q96MR6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CFAP57Q96MR6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CFAP57Q96MR6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP57Q96MR6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP57Q96MR6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP57Q96MR6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP57Q96MR6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP57Q96MR6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP57Q96MR6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP57Q96MR6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP57Q96MR6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP57Q96MR6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP57Q96MR6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP57Q96MR6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP57Q96MR6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP57Q96MR6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP57Q96MR6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms