Protein–RNA interactions for Protein: Q96K37

SLC35E1, Solute carrier family 35 member E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35E1Q96K37 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC35E1Q96K37 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC35E1Q96K37 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC35E1Q96K37 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC35E1Q96K37 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC35E1Q96K37 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC35E1Q96K37 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC35E1Q96K37 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC35E1Q96K37 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC35E1Q96K37 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC35E1Q96K37 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC35E1Q96K37 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC35E1Q96K37 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC35E1Q96K37 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC35E1Q96K37 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC35E1Q96K37 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC35E1Q96K37 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC35E1Q96K37 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC35E1Q96K37 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC35E1Q96K37 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC35E1Q96K37 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC35E1Q96K37 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC35E1Q96K37 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC35E1Q96K37 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC35E1Q96K37 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC35E1Q96K37 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC35E1Q96K37 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC35E1Q96K37 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC35E1Q96K37 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC35E1Q96K37 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC35E1Q96K37 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC35E1Q96K37 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC35E1Q96K37 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC35E1Q96K37 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC35E1Q96K37 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC35E1Q96K37 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC35E1Q96K37 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC35E1Q96K37 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC35E1Q96K37 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC35E1Q96K37 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC35E1Q96K37 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC35E1Q96K37 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC35E1Q96K37 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC35E1Q96K37 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC35E1Q96K37 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC35E1Q96K37 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC35E1Q96K37 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC35E1Q96K37 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC35E1Q96K37 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC35E1Q96K37 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35E1Q96K37 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35E1Q96K37 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35E1Q96K37 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35E1Q96K37 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35E1Q96K37 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35E1Q96K37 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC35E1Q96K37 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC35E1Q96K37 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC35E1Q96K37 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC35E1Q96K37 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35E1Q96K37 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35E1Q96K37 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35E1Q96K37 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35E1Q96K37 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35E1Q96K37 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC35E1Q96K37 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35E1Q96K37 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35E1Q96K37 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35E1Q96K37 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC35E1Q96K37 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC35E1Q96K37 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC35E1Q96K37 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC35E1Q96K37 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC35E1Q96K37 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC35E1Q96K37 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC35E1Q96K37 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC35E1Q96K37 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC35E1Q96K37 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC35E1Q96K37 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC35E1Q96K37 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC35E1Q96K37 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC35E1Q96K37 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC35E1Q96K37 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC35E1Q96K37 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC35E1Q96K37 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC35E1Q96K37 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC35E1Q96K37 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC35E1Q96K37 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC35E1Q96K37 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC35E1Q96K37 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC35E1Q96K37 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC35E1Q96K37 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC35E1Q96K37 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC35E1Q96K37 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC35E1Q96K37 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC35E1Q96K37 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC35E1Q96K37 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC35E1Q96K37 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC35E1Q96K37 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC35E1Q96K37 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms