Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG8

MAGED4, Melanoma-associated antigen D4, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGED4Q96JG8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MAGED4Q96JG8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MAGED4Q96JG8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MAGED4Q96JG8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MAGED4Q96JG8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MAGED4Q96JG8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MAGED4Q96JG8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MAGED4Q96JG8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MAGED4Q96JG8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MAGED4Q96JG8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MAGED4Q96JG8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MAGED4Q96JG8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MAGED4Q96JG8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MAGED4Q96JG8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MAGED4Q96JG8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MAGED4Q96JG8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MAGED4Q96JG8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MAGED4Q96JG8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MAGED4Q96JG8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MAGED4Q96JG8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MAGED4Q96JG8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MAGED4Q96JG8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MAGED4Q96JG8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MAGED4Q96JG8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MAGED4Q96JG8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MAGED4Q96JG8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MAGED4Q96JG8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MAGED4Q96JG8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MAGED4Q96JG8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MAGED4Q96JG8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MAGED4Q96JG8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MAGED4Q96JG8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MAGED4Q96JG8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MAGED4Q96JG8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MAGED4Q96JG8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MAGED4Q96JG8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MAGED4Q96JG8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MAGED4Q96JG8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MAGED4Q96JG8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MAGED4Q96JG8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MAGED4Q96JG8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAGED4Q96JG8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAGED4Q96JG8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAGED4Q96JG8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAGED4Q96JG8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MAGED4Q96JG8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MAGED4Q96JG8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MAGED4Q96JG8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MAGED4Q96JG8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MAGED4Q96JG8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAGED4Q96JG8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAGED4Q96JG8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MAGED4Q96JG8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MAGED4Q96JG8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MAGED4Q96JG8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MAGED4Q96JG8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MAGED4Q96JG8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MAGED4Q96JG8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MAGED4Q96JG8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MAGED4Q96JG8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MAGED4Q96JG8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MAGED4Q96JG8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MAGED4Q96JG8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MAGED4Q96JG8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MAGED4Q96JG8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MAGED4Q96JG8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MAGED4Q96JG8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MAGED4Q96JG8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MAGED4Q96JG8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MAGED4Q96JG8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MAGED4Q96JG8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MAGED4Q96JG8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MAGED4Q96JG8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MAGED4Q96JG8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MAGED4Q96JG8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MAGED4Q96JG8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MAGED4Q96JG8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MAGED4Q96JG8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MAGED4Q96JG8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MAGED4Q96JG8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MAGED4Q96JG8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MAGED4Q96JG8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MAGED4Q96JG8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MAGED4Q96JG8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MAGED4Q96JG8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAGED4Q96JG8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAGED4Q96JG8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAGED4Q96JG8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAGED4Q96JG8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAGED4Q96JG8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAGED4Q96JG8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAGED4Q96JG8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAGED4Q96JG8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAGED4Q96JG8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAGED4Q96JG8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAGED4Q96JG8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAGED4Q96JG8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAGED4Q96JG8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAGED4Q96JG8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MAGED4Q96JG8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms