Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
ZBED3Q96IU2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
ZBED3Q96IU2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ZBED3Q96IU2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ZBED3Q96IU2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ZBED3Q96IU2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ZBED3Q96IU2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
ZBED3Q96IU2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ZBED3Q96IU2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ZBED3Q96IU2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ZBED3Q96IU2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
ZBED3Q96IU2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
ZBED3Q96IU2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ZBED3Q96IU2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ZBED3Q96IU2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ZBED3Q96IU2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
ZBED3Q96IU2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ZBED3Q96IU2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ZBED3Q96IU2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
ZBED3Q96IU2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ZBED3Q96IU2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ZBED3Q96IU2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ZBED3Q96IU2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ZBED3Q96IU2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ZBED3Q96IU2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ZBED3Q96IU2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ZBED3Q96IU2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ZBED3Q96IU2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
ZBED3Q96IU2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
ZBED3Q96IU2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ZBED3Q96IU2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
ZBED3Q96IU2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
ZBED3Q96IU2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ZBED3Q96IU2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ZBED3Q96IU2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
ZBED3Q96IU2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
ZBED3Q96IU2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ZBED3Q96IU2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ZBED3Q96IU2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ZBED3Q96IU2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ZBED3Q96IU2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ZBED3Q96IU2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ZBED3Q96IU2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ZBED3Q96IU2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ZBED3Q96IU2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ZBED3Q96IU2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ZBED3Q96IU2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ZBED3Q96IU2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ZBED3Q96IU2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ZBED3Q96IU2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ZBED3Q96IU2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ZBED3Q96IU2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ZBED3Q96IU2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ZBED3Q96IU2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ZBED3Q96IU2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ZBED3Q96IU2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ZBED3Q96IU2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ZBED3Q96IU2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ZBED3Q96IU2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ZBED3Q96IU2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
ZBED3Q96IU2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ZBED3Q96IU2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ZBED3Q96IU2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ZBED3Q96IU2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ZBED3Q96IU2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ZBED3Q96IU2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ZBED3Q96IU2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ZBED3Q96IU2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ZBED3Q96IU2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
ZBED3Q96IU2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ZBED3Q96IU2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ZBED3Q96IU2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ZBED3Q96IU2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ZBED3Q96IU2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ZBED3Q96IU2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ZBED3Q96IU2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ZBED3Q96IU2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ZBED3Q96IU2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ZBED3Q96IU2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ZBED3Q96IU2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ZBED3Q96IU2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ZBED3Q96IU2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ZBED3Q96IU2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ZBED3Q96IU2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ZBED3Q96IU2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
ZBED3Q96IU2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
ZBED3Q96IU2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ZBED3Q96IU2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ZBED3Q96IU2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ZBED3Q96IU2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
ZBED3Q96IU2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ZBED3Q96IU2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ZBED3Q96IU2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
ZBED3Q96IU2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ZBED3Q96IU2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ZBED3Q96IU2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ZBED3Q96IU2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ZBED3Q96IU2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ZBED3Q96IU2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ZBED3Q96IU2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
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