Protein–RNA interactions for Protein: Q96C00

ZBTB9, Zinc finger and BTB domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBTB9Q96C00 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZBTB9Q96C00 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZBTB9Q96C00 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZBTB9Q96C00 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZBTB9Q96C00 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZBTB9Q96C00 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZBTB9Q96C00 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZBTB9Q96C00 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZBTB9Q96C00 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZBTB9Q96C00 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZBTB9Q96C00 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZBTB9Q96C00 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZBTB9Q96C00 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZBTB9Q96C00 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZBTB9Q96C00 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZBTB9Q96C00 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZBTB9Q96C00 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZBTB9Q96C00 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ZBTB9Q96C00 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZBTB9Q96C00 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZBTB9Q96C00 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZBTB9Q96C00 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZBTB9Q96C00 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZBTB9Q96C00 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZBTB9Q96C00 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZBTB9Q96C00 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZBTB9Q96C00 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZBTB9Q96C00 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZBTB9Q96C00 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZBTB9Q96C00 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZBTB9Q96C00 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZBTB9Q96C00 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZBTB9Q96C00 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZBTB9Q96C00 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZBTB9Q96C00 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZBTB9Q96C00 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZBTB9Q96C00 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZBTB9Q96C00 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZBTB9Q96C00 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZBTB9Q96C00 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZBTB9Q96C00 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZBTB9Q96C00 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZBTB9Q96C00 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZBTB9Q96C00 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZBTB9Q96C00 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZBTB9Q96C00 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZBTB9Q96C00 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZBTB9Q96C00 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZBTB9Q96C00 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZBTB9Q96C00 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZBTB9Q96C00 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZBTB9Q96C00 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZBTB9Q96C00 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZBTB9Q96C00 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZBTB9Q96C00 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZBTB9Q96C00 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZBTB9Q96C00 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZBTB9Q96C00 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZBTB9Q96C00 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZBTB9Q96C00 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZBTB9Q96C00 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZBTB9Q96C00 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZBTB9Q96C00 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZBTB9Q96C00 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZBTB9Q96C00 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZBTB9Q96C00 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZBTB9Q96C00 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ZBTB9Q96C00 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZBTB9Q96C00 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZBTB9Q96C00 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZBTB9Q96C00 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZBTB9Q96C00 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZBTB9Q96C00 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZBTB9Q96C00 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZBTB9Q96C00 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZBTB9Q96C00 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZBTB9Q96C00 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZBTB9Q96C00 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZBTB9Q96C00 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZBTB9Q96C00 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZBTB9Q96C00 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZBTB9Q96C00 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZBTB9Q96C00 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZBTB9Q96C00 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZBTB9Q96C00 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZBTB9Q96C00 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZBTB9Q96C00 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZBTB9Q96C00 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZBTB9Q96C00 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZBTB9Q96C00 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZBTB9Q96C00 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZBTB9Q96C00 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ZBTB9Q96C00 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZBTB9Q96C00 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZBTB9Q96C00 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZBTB9Q96C00 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZBTB9Q96C00 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZBTB9Q96C00 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZBTB9Q96C00 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZBTB9Q96C00 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms