Protein–RNA interactions for Protein: Q93062

RBPMS, RNA-binding protein with multiple splicing, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBPMSQ93062 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBPMSQ93062 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBPMSQ93062 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBPMSQ93062 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBPMSQ93062 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBPMSQ93062 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RBPMSQ93062 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBPMSQ93062 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBPMSQ93062 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBPMSQ93062 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBPMSQ93062 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBPMSQ93062 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBPMSQ93062 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBPMSQ93062 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RBPMSQ93062 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RBPMSQ93062 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBPMSQ93062 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBPMSQ93062 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBPMSQ93062 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBPMSQ93062 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBPMSQ93062 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBPMSQ93062 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBPMSQ93062 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBPMSQ93062 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBPMSQ93062 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBPMSQ93062 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBPMSQ93062 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBPMSQ93062 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBPMSQ93062 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBPMSQ93062 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBPMSQ93062 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBPMSQ93062 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBPMSQ93062 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBPMSQ93062 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBPMSQ93062 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBPMSQ93062 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBPMSQ93062 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBPMSQ93062 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBPMSQ93062 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBPMSQ93062 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RBPMSQ93062 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBPMSQ93062 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBPMSQ93062 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBPMSQ93062 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBPMSQ93062 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBPMSQ93062 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBPMSQ93062 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBPMSQ93062 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RBPMSQ93062 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBPMSQ93062 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBPMSQ93062 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBPMSQ93062 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBPMSQ93062 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBPMSQ93062 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBPMSQ93062 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBPMSQ93062 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBPMSQ93062 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBPMSQ93062 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBPMSQ93062 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBPMSQ93062 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBPMSQ93062 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBPMSQ93062 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBPMSQ93062 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBPMSQ93062 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBPMSQ93062 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBPMSQ93062 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBPMSQ93062 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBPMSQ93062 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBPMSQ93062 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBPMSQ93062 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBPMSQ93062 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBPMSQ93062 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBPMSQ93062 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBPMSQ93062 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RBPMSQ93062 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBPMSQ93062 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBPMSQ93062 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBPMSQ93062 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBPMSQ93062 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBPMSQ93062 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBPMSQ93062 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBPMSQ93062 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBPMSQ93062 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBPMSQ93062 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBPMSQ93062 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBPMSQ93062 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBPMSQ93062 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBPMSQ93062 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBPMSQ93062 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RBPMSQ93062 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBPMSQ93062 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBPMSQ93062 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBPMSQ93062 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RBPMSQ93062 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBPMSQ93062 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBPMSQ93062 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RBPMSQ93062 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBPMSQ93062 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RBPMSQ93062 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RBPMSQ93062 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms