Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
PRG4Q92954 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC44.8■■■■■ 4.76
PRG4Q92954 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
PRG4Q92954 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC44.79■■■■■ 4.76
PRG4Q92954 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
PRG4Q92954 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
PRG4Q92954 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.76
PRG4Q92954 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC44.75■■■■■ 4.75
PRG4Q92954 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
PRG4Q92954 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
PRG4Q92954 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC44.72■■■■■ 4.75
PRG4Q92954 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
PRG4Q92954 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC44.7■■■■■ 4.75
PRG4Q92954 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.75
PRG4Q92954 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
PRG4Q92954 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
PRG4Q92954 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC44.65■■■■■ 4.74
PRG4Q92954 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.73
PRG4Q92954 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
PRG4Q92954 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
PRG4Q92954 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC44.62■■■■■ 4.73
PRG4Q92954 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC44.62■■■■■ 4.73
PRG4Q92954 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC44.62■■■■■ 4.73
PRG4Q92954 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC44.59■■■■■ 4.73
PRG4Q92954 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC44.59■■■■■ 4.73
PRG4Q92954 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC44.58■■■■■ 4.73
PRG4Q92954 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
PRG4Q92954 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
PRG4Q92954 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC44.53■■■■■ 4.72
PRG4Q92954 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC44.52■■■■■ 4.72
PRG4Q92954 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
PRG4Q92954 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
PRG4Q92954 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC44.51■■■■■ 4.72
PRG4Q92954 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC44.51■■■■■ 4.72
PRG4Q92954 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
PRG4Q92954 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC44.5■■■■■ 4.71
PRG4Q92954 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
PRG4Q92954 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
PRG4Q92954 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
PRG4Q92954 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC44.45■■■■■ 4.71
PRG4Q92954 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC44.43■■■■■ 4.7
PRG4Q92954 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC44.41■■■■■ 4.7
PRG4Q92954 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
PRG4Q92954 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC44.41■■■■■ 4.7
PRG4Q92954 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
PRG4Q92954 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC44.41■■■■■ 4.7
PRG4Q92954 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC44.41■■■■■ 4.7
PRG4Q92954 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC44.41■■■■■ 4.7
PRG4Q92954 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC44.4■■■■■ 4.7
PRG4Q92954 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC44.4■■■■■ 4.7
PRG4Q92954 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
PRG4Q92954 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
PRG4Q92954 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC44.36■■■■■ 4.69
PRG4Q92954 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
PRG4Q92954 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC44.33■■■■■ 4.69
PRG4Q92954 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
PRG4Q92954 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.68
PRG4Q92954 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.29■■■■■ 4.68
PRG4Q92954 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
PRG4Q92954 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
PRG4Q92954 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC44.25■■■■■ 4.67
PRG4Q92954 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
PRG4Q92954 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
PRG4Q92954 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
PRG4Q92954 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
PRG4Q92954 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
PRG4Q92954 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC44.2■■■■■ 4.67
PRG4Q92954 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.17■■■■■ 4.66
PRG4Q92954 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC44.17■■■■■ 4.66
PRG4Q92954 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC44.16■■■■■ 4.66
PRG4Q92954 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC44.16■■■■■ 4.66
PRG4Q92954 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC44.14■■■■■ 4.66
PRG4Q92954 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.66
PRG4Q92954 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.12■■■■■ 4.65
PRG4Q92954 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC44.1■■■■■ 4.65
PRG4Q92954 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC44.1■■■■■ 4.65
PRG4Q92954 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC44.1■■■■■ 4.65
PRG4Q92954 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
PRG4Q92954 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC44.07■■■■■ 4.65
PRG4Q92954 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.07■■■■■ 4.64
PRG4Q92954 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC44.07■■■■■ 4.64
PRG4Q92954 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC44.07■■■■■ 4.64
PRG4Q92954 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
PRG4Q92954 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC44.06■■■■■ 4.64
PRG4Q92954 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.06■■■■■ 4.64
PRG4Q92954 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
PRG4Q92954 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC44.04■■■■■ 4.64
PRG4Q92954 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.02■■■■■ 4.64
PRG4Q92954 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
PRG4Q92954 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
PRG4Q92954 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
PRG4Q92954 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
PRG4Q92954 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC44■■■■■ 4.63
PRG4Q92954 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
PRG4Q92954 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
PRG4Q92954 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.99■■■■■ 4.63
PRG4Q92954 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
PRG4Q92954 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
PRG4Q92954 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC43.96■■■■■ 4.63
PRG4Q92954 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms