Protein–RNA interactions for Protein: Q92747

ARPC1A, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1AQ92747 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARPC1AQ92747 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARPC1AQ92747 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARPC1AQ92747 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARPC1AQ92747 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARPC1AQ92747 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARPC1AQ92747 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARPC1AQ92747 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARPC1AQ92747 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARPC1AQ92747 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARPC1AQ92747 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARPC1AQ92747 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ARPC1AQ92747 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARPC1AQ92747 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARPC1AQ92747 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARPC1AQ92747 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARPC1AQ92747 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARPC1AQ92747 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARPC1AQ92747 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARPC1AQ92747 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARPC1AQ92747 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARPC1AQ92747 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARPC1AQ92747 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARPC1AQ92747 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARPC1AQ92747 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ARPC1AQ92747 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARPC1AQ92747 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARPC1AQ92747 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARPC1AQ92747 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARPC1AQ92747 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARPC1AQ92747 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARPC1AQ92747 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARPC1AQ92747 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARPC1AQ92747 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARPC1AQ92747 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARPC1AQ92747 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARPC1AQ92747 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARPC1AQ92747 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARPC1AQ92747 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARPC1AQ92747 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARPC1AQ92747 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARPC1AQ92747 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARPC1AQ92747 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARPC1AQ92747 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARPC1AQ92747 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARPC1AQ92747 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ARPC1AQ92747 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARPC1AQ92747 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARPC1AQ92747 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARPC1AQ92747 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARPC1AQ92747 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARPC1AQ92747 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ARPC1AQ92747 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ARPC1AQ92747 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARPC1AQ92747 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARPC1AQ92747 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARPC1AQ92747 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARPC1AQ92747 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARPC1AQ92747 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ARPC1AQ92747 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ARPC1AQ92747 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ARPC1AQ92747 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARPC1AQ92747 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARPC1AQ92747 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARPC1AQ92747 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARPC1AQ92747 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARPC1AQ92747 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARPC1AQ92747 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARPC1AQ92747 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARPC1AQ92747 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARPC1AQ92747 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARPC1AQ92747 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARPC1AQ92747 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARPC1AQ92747 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARPC1AQ92747 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARPC1AQ92747 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARPC1AQ92747 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ARPC1AQ92747 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARPC1AQ92747 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARPC1AQ92747 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARPC1AQ92747 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARPC1AQ92747 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARPC1AQ92747 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARPC1AQ92747 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARPC1AQ92747 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARPC1AQ92747 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARPC1AQ92747 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARPC1AQ92747 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARPC1AQ92747 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARPC1AQ92747 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARPC1AQ92747 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARPC1AQ92747 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARPC1AQ92747 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ARPC1AQ92747 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARPC1AQ92747 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARPC1AQ92747 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARPC1AQ92747 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARPC1AQ92747 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARPC1AQ92747 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARPC1AQ92747 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.2 ms