Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF42

UBASH3B, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, humanhuman

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3BQ8TF42 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBASH3BQ8TF42 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBASH3BQ8TF42 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBASH3BQ8TF42 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBASH3BQ8TF42 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBASH3BQ8TF42 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBASH3BQ8TF42 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBASH3BQ8TF42 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBASH3BQ8TF42 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBASH3BQ8TF42 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBASH3BQ8TF42 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBASH3BQ8TF42 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBASH3BQ8TF42 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBASH3BQ8TF42 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBASH3BQ8TF42 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBASH3BQ8TF42 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBASH3BQ8TF42 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBASH3BQ8TF42 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBASH3BQ8TF42 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBASH3BQ8TF42 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBASH3BQ8TF42 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBASH3BQ8TF42 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBASH3BQ8TF42 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBASH3BQ8TF42 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBASH3BQ8TF42 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBASH3BQ8TF42 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBASH3BQ8TF42 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBASH3BQ8TF42 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBASH3BQ8TF42 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBASH3BQ8TF42 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBASH3BQ8TF42 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBASH3BQ8TF42 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBASH3BQ8TF42 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBASH3BQ8TF42 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBASH3BQ8TF42 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBASH3BQ8TF42 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBASH3BQ8TF42 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBASH3BQ8TF42 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBASH3BQ8TF42 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBASH3BQ8TF42 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UBASH3BQ8TF42 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBASH3BQ8TF42 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBASH3BQ8TF42 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBASH3BQ8TF42 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBASH3BQ8TF42 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBASH3BQ8TF42 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBASH3BQ8TF42 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBASH3BQ8TF42 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBASH3BQ8TF42 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBASH3BQ8TF42 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBASH3BQ8TF42 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBASH3BQ8TF42 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBASH3BQ8TF42 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBASH3BQ8TF42 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBASH3BQ8TF42 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBASH3BQ8TF42 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBASH3BQ8TF42 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBASH3BQ8TF42 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBASH3BQ8TF42 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBASH3BQ8TF42 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBASH3BQ8TF42 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBASH3BQ8TF42 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBASH3BQ8TF42 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBASH3BQ8TF42 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBASH3BQ8TF42 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBASH3BQ8TF42 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBASH3BQ8TF42 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBASH3BQ8TF42 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBASH3BQ8TF42 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBASH3BQ8TF42 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBASH3BQ8TF42 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBASH3BQ8TF42 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBASH3BQ8TF42 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBASH3BQ8TF42 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBASH3BQ8TF42 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBASH3BQ8TF42 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBASH3BQ8TF42 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBASH3BQ8TF42 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBASH3BQ8TF42 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBASH3BQ8TF42 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBASH3BQ8TF42 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBASH3BQ8TF42 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBASH3BQ8TF42 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
UBASH3BQ8TF42 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBASH3BQ8TF42 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBASH3BQ8TF42 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBASH3BQ8TF42 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBASH3BQ8TF42 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
UBASH3BQ8TF42 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBASH3BQ8TF42 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBASH3BQ8TF42 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBASH3BQ8TF42 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBASH3BQ8TF42 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBASH3BQ8TF42 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBASH3BQ8TF42 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBASH3BQ8TF42 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBASH3BQ8TF42 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBASH3BQ8TF42 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBASH3BQ8TF42 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBASH3BQ8TF42 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
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