Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV9

RHOXF1, Rhox homeobox family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF1Q8NHV9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOXF1Q8NHV9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHOXF1Q8NHV9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOXF1Q8NHV9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOXF1Q8NHV9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOXF1Q8NHV9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOXF1Q8NHV9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHOXF1Q8NHV9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHOXF1Q8NHV9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHOXF1Q8NHV9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHOXF1Q8NHV9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHOXF1Q8NHV9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHOXF1Q8NHV9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHOXF1Q8NHV9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RHOXF1Q8NHV9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOXF1Q8NHV9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOXF1Q8NHV9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOXF1Q8NHV9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOXF1Q8NHV9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOXF1Q8NHV9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOXF1Q8NHV9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOXF1Q8NHV9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOXF1Q8NHV9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOXF1Q8NHV9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOXF1Q8NHV9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOXF1Q8NHV9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOXF1Q8NHV9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOXF1Q8NHV9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOXF1Q8NHV9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOXF1Q8NHV9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOXF1Q8NHV9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOXF1Q8NHV9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOXF1Q8NHV9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOXF1Q8NHV9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOXF1Q8NHV9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOXF1Q8NHV9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOXF1Q8NHV9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOXF1Q8NHV9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RHOXF1Q8NHV9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHOXF1Q8NHV9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOXF1Q8NHV9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOXF1Q8NHV9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOXF1Q8NHV9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHOXF1Q8NHV9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOXF1Q8NHV9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHOXF1Q8NHV9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOXF1Q8NHV9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHOXF1Q8NHV9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOXF1Q8NHV9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHOXF1Q8NHV9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHOXF1Q8NHV9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOXF1Q8NHV9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHOXF1Q8NHV9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHOXF1Q8NHV9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOXF1Q8NHV9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOXF1Q8NHV9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOXF1Q8NHV9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOXF1Q8NHV9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOXF1Q8NHV9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOXF1Q8NHV9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHOXF1Q8NHV9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOXF1Q8NHV9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOXF1Q8NHV9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHOXF1Q8NHV9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOXF1Q8NHV9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHOXF1Q8NHV9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHOXF1Q8NHV9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHOXF1Q8NHV9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHOXF1Q8NHV9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHOXF1Q8NHV9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHOXF1Q8NHV9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RHOXF1Q8NHV9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOXF1Q8NHV9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHOXF1Q8NHV9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOXF1Q8NHV9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOXF1Q8NHV9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOXF1Q8NHV9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOXF1Q8NHV9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHOXF1Q8NHV9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHOXF1Q8NHV9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHOXF1Q8NHV9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHOXF1Q8NHV9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHOXF1Q8NHV9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOXF1Q8NHV9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOXF1Q8NHV9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOXF1Q8NHV9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOXF1Q8NHV9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOXF1Q8NHV9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOXF1Q8NHV9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOXF1Q8NHV9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOXF1Q8NHV9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOXF1Q8NHV9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOXF1Q8NHV9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOXF1Q8NHV9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOXF1Q8NHV9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOXF1Q8NHV9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOXF1Q8NHV9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOXF1Q8NHV9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOXF1Q8NHV9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOXF1Q8NHV9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms